More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2913 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 247 aa  488  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00331942  hitchhiker  0.00525068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.62 
 
 		 251 aa  345  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.57 
 
 		 250 aa  334  7.999999999999999e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  63.93 
 
 		 250 aa  325  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.3 
 
 		 251 aa  312  2.9999999999999996e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2475  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  65.53 
 
 		 258 aa  311  7.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000418459  decreased coverage  0.00157029 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16710  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  62.3 
 
 		 250 aa  310  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1682  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.33 
 
 		 252 aa  280  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.38 
 
 		 255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5135  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.51 
 
 		 251 aa  257  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1150  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.42 
 
 		 256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.82 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.5 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.54 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.08 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12779  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.79 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0740489  normal  0.553244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.32 
 
 		 272 aa  201  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.951594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.99 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 248 aa  175  6e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.31 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4745  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146753  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 254 aa  165  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3219  short chain dehydrogenase  41.3 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  40.89 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5079  short chain dehydrogenase  40.49 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.703587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  42.23 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5018  short chain dehydrogenase  40.49 
 
 		 254 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5842  short chain dehydrogenase  40.49 
 
 		 254 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4337  short chain dehydrogenase  40.49 
 
 		 254 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351229  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 266 aa  158  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 		 254 aa  158  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5045  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5719  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6406  short chain dehydrogenase  39.52 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3478  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 		 255 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 		 253 aa  152  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  39.2 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  38.93 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5098  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  38.52 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 254 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597888  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 254 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  38.93 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0620  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.43 
 
 		 250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.890979 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 		 257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2074  short chain dehydrogenase  38.11 
 
 		 255 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0334632  normal  0.0500399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  38.52 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 		 247 aa  145  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40890  short chain dehydrogenase  37.3 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  36.89 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3468  short chain dehydrogenase  37.3 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  38.37 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 		 256 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.675058  normal  0.0165705 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237012  normal  0.451819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.87 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3560  short chain dehydrogenase  38.11 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2456  short chain dehydrogenase  36.89 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716886 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.33 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  38.27 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.92 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2375  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 265 aa  139  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 		 249 aa  138  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.865881  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.58 
 
 		 271 aa  138  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0523  short chain dehydrogenase  39.26 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  39.6 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.42 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.465274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.21 
 
 		 248 aa  135  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 		 262 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0245  short chain dehydrogenase  38.84 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.864875  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0944  short chain dehydrogenase  38.84 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2139  short chain dehydrogenase  37.93 
 
 		 254 aa  135  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 		 267 aa  135  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.239754  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1428  short chain dehydrogenase  38.84 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1625  short chain dehydrogenase  38.84 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2651  short chain dehydrogenase  38.84 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0281  short chain dehydrogenase  38.84 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 		 266 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2513  short chain dehydrogenase  38.84 
 
 		 256 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>