More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2371 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 256 aa  511  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0429161  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.62 
 
 		 256 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.62 
 
 		 256 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.84 
 
 		 256 aa  332  4e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.14 
 
 		 256 aa  321  6e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419778 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.39 
 
 		 256 aa  305  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0123285 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4745  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146753  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  42.23 
 
 		 255 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  39.68 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.71 
 
 		 266 aa  176  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  39.44 
 
 		 256 aa  175  7e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 253 aa  172  6.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  40.87 
 
 		 255 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  40.24 
 
 		 254 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 254 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  40.48 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3560  short chain dehydrogenase  40.48 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 		 254 aa  168  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597888  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.818797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5045  short chain dehydrogenase  38.8 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  37.94 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 255 aa  164  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 254 aa  164  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 254 aa  164  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 		 254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2456  short chain dehydrogenase  39.6 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716886 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2074  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0334632  normal  0.0500399 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.675058  normal  0.0165705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  39.84 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  38.8 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 284 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 		 257 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0523  short chain dehydrogenase  39.04 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16710  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.24 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 		 252 aa  159  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 284 aa  158  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 284 aa  158  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 257 aa  158  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.951594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5079  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.703587  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0245  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.864875  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6406  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0944  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  36.51 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0281  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3478  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2513  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40890  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3468  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1428  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1625  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2651  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5719  short chain dehydrogenase  37.2 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3219  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4337  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351229  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5018  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 254 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5842  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 254 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 		 248 aa  155  8e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.715574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.68 
 
 		 255 aa  155  8e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.94 
 
 		 250 aa  154  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  36.69 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1150  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.19 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.679582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.66 
 
 		 246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0736  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.69 
 
 		 264 aa  152  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00191984  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 252 aa  152  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 257 aa  152  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.15 
 
 		 251 aa  151  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  38.25 
 
 		 260 aa  151  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10784  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 		 248 aa  151  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 		 247 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 		 247 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 		 247 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2403  gluconate 5-dehydrogenase  38.98 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.525317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>