More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0859 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 248 aa  508  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.715574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.22 
 
 		 254 aa  299  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.818797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.85 
 
 		 254 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.26 
 
 		 258 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.679582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.01 
 
 		 270 aa  251  6e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.374056  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.29 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.29 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.29 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17920  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  46.31 
 
 		 251 aa  208  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.355358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.41 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 		 266 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  41.13 
 
 		 253 aa  176  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 254 aa  168  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  39.68 
 
 		 254 aa  161  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  39.11 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 257 aa  158  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  38.65 
 
 		 254 aa  158  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  39.11 
 
 		 253 aa  158  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  38.71 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  38.71 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 		 256 aa  155  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 		 253 aa  156  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3219  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6406  short chain dehydrogenase  39.44 
 
 		 254 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  38.19 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5079  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 		 260 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.703587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4337  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351229  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3560  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40890  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3468  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2074  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 		 255 aa  152  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0334632  normal  0.0500399 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 		 256 aa  151  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  37.8 
 
 		 255 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5719  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5018  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  35.48 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 262 aa  150  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5842  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  39.29 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745234  normal  0.0404538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.3 
 
 		 252 aa  149  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.24 
 
 		 248 aa  149  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  36.61 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0523  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  34.66 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.385793 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108758  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.564431  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0123285 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5045  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2801  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.66 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2456  short chain dehydrogenase  36.61 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716886 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419778 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 255 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2139  short chain dehydrogenase  37.97 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  36.76 
 
 		 255 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 		 252 aa  145  9e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4369  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.92 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.1 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0245  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.864875  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1428  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0944  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1625  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2651  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0281  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.1 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2513  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.951594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0593655  normal  0.256231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1738  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.94 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.94 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.94 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.17 
 
 		 249 aa  142  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.66 
 
 		 249 aa  142  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 		 256 aa  142  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0429161  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2072  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.95 
 
 		 247 aa  141  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000027021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>