More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5265 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5265  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 265 aa  530  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4682  short chain dehydrogenase  87.65 
 
 		 244 aa  434  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4768  short chain dehydrogenase  87.65 
 
 		 244 aa  434  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0810301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5067  short chain dehydrogenase  87.65 
 
 		 244 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325095  normal  0.532115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1491  short chain dehydrogenase  87.98 
 
 		 233 aa  427  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13582  short chain dehydrogenase  75.5 
 
 		 259 aa  362  2e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.66 
 
 		 261 aa  293  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3980  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.36 
 
 		 267 aa  289  4e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2742  short chain dehydrogenase  58.26 
 
 		 252 aa  276  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0442377  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1386  short chain dehydrogenase  55.73 
 
 		 256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.746633  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1512  short chain dehydrogenase  48.39 
 
 		 262 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.538743  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1462  short chain dehydrogenase  47.97 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780505  normal  0.472933 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2137  short chain dehydrogenase  49.59 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.422468  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3623  short chain dehydrogenase  47.79 
 
 		 280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2830  short chain dehydrogenase  48.02 
 
 		 247 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2066  short chain dehydrogenase  47.95 
 
 		 251 aa  204  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552994  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3749  short chain dehydrogenase  47.93 
 
 		 254 aa  202  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2633  short chain dehydrogenase  49.21 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522404  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8757  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 		 256 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.215149  normal  0.0548986 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.4 
 
 		 250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17920  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  39.43 
 
 		 251 aa  141  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.355358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 		 295 aa  141  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0136754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1270  Short-chain dehydrogenase  37.19 
 
 		 248 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 275 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 		 261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.197864  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 249 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790867  normal  0.270985 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5079  short chain dehydrogenase  34.82 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.703587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3219  short chain dehydrogenase  34.82 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  34.82 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  34.82 
 
 		 254 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5135  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.55 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.07 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.66 
 
 		 246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5018  short chain dehydrogenase  34.01 
 
 		 254 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5842  short chain dehydrogenase  34.01 
 
 		 254 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  34.66 
 
 		 252 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4337  short chain dehydrogenase  34.01 
 
 		 254 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351229  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  36.65 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  36.29 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.1 
 
 		 246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7064  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  36.93 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0291  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.37 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 		 255 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 		 257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5719  short chain dehydrogenase  34.41 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.99 
 
 		 247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1150  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.59 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2773  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.96 
 
 		 286 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2928  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.96 
 
 		 286 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458345  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1148  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.96 
 
 		 323 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 		 253 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.55 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1719  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.7 
 
 		 249 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 		 272 aa  125  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0508  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.37 
 
 		 248 aa  125  9e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 265 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16710  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.08 
 
 		 250 aa  125  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 		 264 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6406  short chain dehydrogenase  34.41 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7174  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 256 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 266 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0659  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.84 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.372694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  31.5 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  35.2 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0201969  normal  0.963829 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.58 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5045  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1139  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  31.97 
 
 		 266 aa  122  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  32.79 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  32.3 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1561  short chain dehydrogenase  35.95 
 
 		 516 aa  122  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.636243  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>