More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2087 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 245 aa  484  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  87.35 
 
 		 245 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5080  short chain dehydrogenase  55.83 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  46.53 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3326  short chain dehydrogenase  55.36 
 
 		 246 aa  195  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3239  short chain dehydrogenase  56.25 
 
 		 245 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161967  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.98 
 
 		 243 aa  191  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3131  short chain dehydrogenase  55.36 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  44.64 
 
 		 270 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  42.8 
 
 		 237 aa  161  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  43.78 
 
 		 240 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  43.78 
 
 		 240 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  43.78 
 
 		 240 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  43.78 
 
 		 240 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  44.64 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 246 aa  155  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.85 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  44.64 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  43.15 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  43.1 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  43.1 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.34 
 
 		 238 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.996874 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 		 238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261739  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  43.51 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 		 238 aa  145  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  34.03 
 
 		 222 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3511  short chain dehydrogenase  41.35 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 		 250 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2546  short chain dehydrogenase  35.37 
 
 		 238 aa  141  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 		 239 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0910719 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  42.03 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  42.32 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.65 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2086  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879174  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0938  Short-chain alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746042  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.129059  normal  0.0371904 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.06 
 
 		 249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 		 244 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01548  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_8G05590)  32.25 
 
 		 276 aa  107  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.90356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  34.69 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4327  putative short chain dehydrogenase  54.46 
 
 		 140 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 		 238 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 248 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.27 
 
 		 250 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 267 aa  101  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  34.57 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0834  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.53 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.443482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1670  oxidoreductase  34.16 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0171077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1384  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.981738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.87063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3574  short chain dehydrogenase  31.32 
 
 		 267 aa  99.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11528  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34130  oxidoreductase  31.71 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 250 aa  98.6  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35800  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  33.73 
 
 		 285 aa  98.6  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 		 249 aa  98.6  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.743298  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1040  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 		 231 aa  98.2  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.268207  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000027503  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3809  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  33.76 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3892  putative oxidoreductase  32.65 
 
 		 244 aa  97.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.300054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3225  bacilysin biosynthesis oxidoreductase BacC  33.33 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.24 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 		 257 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 		 257 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.429705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 		 248 aa  95.5  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.33 
 
 		 255 aa  95.5  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000312486  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1536  oxidoreductase  31.98 
 
 		 257 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0824  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.83 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.394944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1364  putative glucose/ribitol dehydrogenase  31.47 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.333439999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4230  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 		 248 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3759  oxidoreductase  31.58 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.108381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>