More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1384 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1384  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
257 aa  523  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.981738  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  87.16 
 
 
257 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.429705  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  87.16 
 
 
257 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30491  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.84 
 
 
256 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6863  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.38 
 
 
261 aa  316  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224503  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.68 
 
 
256 aa  315  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0826034  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.45 
 
 
256 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.14 
 
 
264 aa  315  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.473895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.45 
 
 
256 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.210768 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.45 
 
 
256 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.35 
 
 
255 aa  315  6e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000312486  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1496  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.32 
 
 
255 aa  308  8e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4263  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  57.03 
 
 
257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 
260 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 
260 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 
260 aa  299  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.73 
 
 
250 aa  298  6e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.443482  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.62 
 
 
260 aa  295  6e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0824  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  58.23 
 
 
255 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.394944  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1363  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  57.65 
 
 
263 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.62 
 
 
254 aa  270  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07016  oxidoreductase  54.22 
 
 
256 aa  268  5e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2080  hypothetical protein  54.26 
 
 
254 aa  261  8e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2070  hypothetical protein  53.54 
 
 
254 aa  259  4e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.22 
 
 
256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0908  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.88 
 
 
257 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.02 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185948  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
253 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
269 aa  144  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
284 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
284 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1447  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
257 aa  142  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
284 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690053  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
244 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202963  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
247 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203668  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
265 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.09 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
247 aa  136  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
246 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596846  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 
249 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 
253 aa  135  9e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 
261 aa  135  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.197864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
244 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1531  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.14 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356437 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3531  short chain dehydrogenase  34.38 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0259595  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
239 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
255 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
262 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
237 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.138862 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1276  short chain dehydrogenase  36.25 
 
 
245 aa  132  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127244 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.92 
 
 
245 aa  132  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1874  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.74 
 
 
245 aa  132  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00756891  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
255 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000026464  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
248 aa  131  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.38 
 
 
251 aa  130  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.157032 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  34.66 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2429  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.25 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047151  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5253  short chain dehydrogenase  33.59 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.53 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0819  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
236 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.65 
 
 
246 aa  129  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0302  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 
236 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0186456  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  32.3 
 
 
265 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0834  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.25 
 
 
299 aa  130  3e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
244 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3225  bacilysin biosynthesis oxidoreductase BacC  32.13 
 
 
242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
244 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.977766  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
260 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379733  normal  0.717658 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 
261 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.53 
 
 
247 aa  128  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 
245 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1917  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.242165  hitchhiker  0.00000598098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
241 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550134  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  32.3 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  35.6 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0265  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.2 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.67 
 
 
246 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5126  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
236 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
262 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
250 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767599  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1818  short chain dehydrogenase  34.77 
 
 
255 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  33.86 
 
 
247 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 
260 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0651  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.18 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>