More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2011 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000026464  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.82 
 
 
255 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.98 
 
 
284 aa  351  7e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690053  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.59 
 
 
284 aa  350  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.59 
 
 
284 aa  350  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.45 
 
 
257 aa  313  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.5 
 
 
269 aa  305  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490392  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05637  short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_4G13550)  56.4 
 
 
262 aa  296  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.35699  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1050  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 
253 aa  292  4e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.150046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.27 
 
 
258 aa  289  4e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.27 
 
 
260 aa  286  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.24 
 
 
255 aa  281  6.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.157032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.1 
 
 
260 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379733  normal  0.717658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.3 
 
 
257 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
260 aa  261  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0083213  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.22 
 
 
263 aa  256  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.993819  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54 
 
 
256 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02410  conserved hypothetical protein  49.8 
 
 
264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.167898  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.2 
 
 
259 aa  246  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20270  beta-ketoacyl reductase  49.8 
 
 
256 aa  241  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.483952 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.59 
 
 
267 aa  239  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.223679  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.17 
 
 
268 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0330322 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00784  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_1G14540)  49.23 
 
 
281 aa  237  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1187  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.81 
 
 
256 aa  236  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.206395 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 
256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.8 
 
 
257 aa  234  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.105018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.36 
 
 
268 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal  0.73895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5272  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.38 
 
 
268 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.61 
 
 
258 aa  228  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10306  predicted protein  46.67 
 
 
267 aa  226  3e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0751  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR)  52.96 
 
 
269 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.17 
 
 
268 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.39 
 
 
256 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.22 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.46 
 
 
267 aa  216  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.425244  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2493  gluconate 5-dehydrogenase  45.35 
 
 
274 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  45.88 
 
 
267 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61314  peroxisomal 2,4- dienoyl-CoA reductase  43.85 
 
 
269 aa  203  2e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35804  normal  0.723211 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2919  gluconate 5-dehydrogenase  44.09 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2008  gluconate 5-dehydrogenase  45.74 
 
 
263 aa  199  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1695  gluconate 5-dehydrogenase  45.74 
 
 
263 aa  199  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2873  gluconate 5-dehydrogenase  42.91 
 
 
263 aa  195  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.31 
 
 
257 aa  195  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0441783  normal  0.700268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3360  gluconate 5-dehydrogenase  45.25 
 
 
263 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.319469  normal  0.757652 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1443  gluconate 5-dehydrogenase  43.85 
 
 
260 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325951  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1851  gluconate 5-dehydrogenase  45.14 
 
 
260 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1484  gluconate 5-dehydrogenase  43.46 
 
 
260 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0155973  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  40.64 
 
 
260 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2353  gluconate 5-dehydrogenase  44.88 
 
 
262 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1763  gluconate 5-dehydrogenase  43.46 
 
 
260 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.401808  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  40.55 
 
 
259 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1844  gluconate 5-dehydrogenase  43.7 
 
 
263 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250447  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1409  gluconate 5-dehydrogenase  43.58 
 
 
260 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2403  gluconate 5-dehydrogenase  43.75 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.525317  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2306  gluconate 5-dehydrogenase  44.57 
 
 
262 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833457 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 
258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.063344  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
256 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
256 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08403  conserved hypothetical protein  42.02 
 
 
280 aa  171  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.706703  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
254 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
256 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
259 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4004  gluconate 5-dehydrogenase  40.94 
 
 
267 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
252 aa  161  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  39.3 
 
 
259 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
252 aa  159  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
257 aa  158  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
264 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000174096  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
258 aa  155  6e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16609  predicted protein  40.08 
 
 
266 aa  154  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2801  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.24 
 
 
249 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
254 aa  152  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.66 
 
 
249 aa  151  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  34.14 
 
 
252 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
256 aa  149  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2389  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  39.3 
 
 
255 aa  149  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5273  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.06 
 
 
260 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251333 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
257 aa  149  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
261 aa  149  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745234  normal  0.0404538 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
259 aa  149  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
246 aa  149  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  35.57 
 
 
256 aa  149  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  36.69 
 
 
248 aa  148  7e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
256 aa  148  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0123285 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.1 
 
 
246 aa  148  9e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.84 
 
 
245 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17920  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  40.4 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.355358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1603  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.75 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0440497  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.991587  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.95 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.1 
 
 
250 aa  146  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7331  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.11 
 
 
249 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
255 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.7 
 
 
246 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>