More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2237 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
252 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.83 
 
 
256 aa  371  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.24 
 
 
253 aa  345  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.246968  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.86 
 
 
253 aa  341  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.86 
 
 
253 aa  340  9e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108758  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.86 
 
 
253 aa  340  9e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.564431  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.03 
 
 
253 aa  337  8e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.7 
 
 
253 aa  322  5e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.04 
 
 
255 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 
257 aa  199  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  42.91 
 
 
260 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
255 aa  188  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
255 aa  186  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  42.25 
 
 
259 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17930  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  45.97 
 
 
268 aa  182  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.481868 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  40.32 
 
 
257 aa  181  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.99 
 
 
250 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6365  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 
263 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
259 aa  175  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  44 
 
 
254 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.044107  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
255 aa  172  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
252 aa  172  5e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.36 
 
 
246 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
255 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710312  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
254 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.36 
 
 
246 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.87 
 
 
251 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00521448  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2037  short chain dehydrogenase  41.77 
 
 
262 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00988022  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
257 aa  169  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2383  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.94 
 
 
253 aa  168  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  41.57 
 
 
260 aa  168  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5289  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
263 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0559291  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
256 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  41.63 
 
 
259 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
264 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1568  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 
301 aa  165  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
272 aa  165  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.382394  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0908  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.27 
 
 
257 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1655  short chain dehydrogenase  38.85 
 
 
261 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0365832  normal  0.0290451 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3124  short chain dehydrogenase  42.17 
 
 
262 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  44.49 
 
 
254 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0537  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  42.97 
 
 
256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.27 
 
 
247 aa  165  8e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2753  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
260 aa  164  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.53957  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0344  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  39.53 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1985  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  39.76 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.44 
 
 
269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3982  short chain dehydrogenase  39.69 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 
257 aa  162  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1971  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.47 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2032  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  39.3 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 
248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  39.29 
 
 
258 aa  161  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000166105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.62 
 
 
247 aa  161  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17920  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  41.41 
 
 
251 aa  161  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.355358 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.14 
 
 
254 aa  161  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1443  gluconate 5-dehydrogenase  38.25 
 
 
260 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325951  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2202  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  39.3 
 
 
253 aa  160  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
285 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0775551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1317  Short-chain dehydrogenase  40.16 
 
 
288 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169913  normal  0.0434292 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1484  gluconate 5-dehydrogenase  37.85 
 
 
260 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0155973  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  37.94 
 
 
255 aa  159  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3515  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  41.57 
 
 
255 aa  159  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1909  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.91 
 
 
253 aa  159  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00371976  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3017  short chain dehydrogenase  38.82 
 
 
260 aa  159  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1763  gluconate 5-dehydrogenase  38.25 
 
 
260 aa  158  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.401808  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2353  gluconate 5-dehydrogenase  37.7 
 
 
262 aa  158  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
258 aa  158  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
270 aa  158  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.374056  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1693  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.91 
 
 
253 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.523034  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
288 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1803  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.91 
 
 
253 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711857  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1566  short chain dehydrogenase  38.19 
 
 
258 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2643  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.91 
 
 
253 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.802213  normal  0.105966 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0348  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.71 
 
 
244 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  37.45 
 
 
256 aa  156  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
300 aa  156  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5588  dehydrogenase  37.96 
 
 
285 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
286 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
258 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29820  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  42.97 
 
 
261 aa  156  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3233  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.98 
 
 
253 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000782926 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
257 aa  156  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0392  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.76 
 
 
258 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.7 
 
 
245 aa  156  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5467  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
305 aa  156  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1716  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  39.37 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0659  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.14 
 
 
245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.372694  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  36.51 
 
 
267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.15 
 
 
250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00209821  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0396  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.76 
 
 
258 aa  155  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2072  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.89 
 
 
247 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000027021  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.52 
 
 
257 aa  155  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000174096  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  37.8 
 
 
265 aa  155  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>