More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2567 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  100 
 
 
267 aa  541  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1844  gluconate 5-dehydrogenase  89.27 
 
 
263 aa  485  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250447  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2493  gluconate 5-dehydrogenase  83.14 
 
 
274 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2353  gluconate 5-dehydrogenase  82.31 
 
 
262 aa  443  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2919  gluconate 5-dehydrogenase  78.2 
 
 
264 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2873  gluconate 5-dehydrogenase  78.16 
 
 
263 aa  427  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2008  gluconate 5-dehydrogenase  77.39 
 
 
263 aa  408  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1695  gluconate 5-dehydrogenase  77.39 
 
 
263 aa  408  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1443  gluconate 5-dehydrogenase  72.09 
 
 
260 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325951  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3360  gluconate 5-dehydrogenase  74.71 
 
 
263 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.319469  normal  0.757652 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1484  gluconate 5-dehydrogenase  71.71 
 
 
260 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0155973  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1409  gluconate 5-dehydrogenase  72.59 
 
 
260 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1763  gluconate 5-dehydrogenase  70.93 
 
 
260 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.401808  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1851  gluconate 5-dehydrogenase  70.66 
 
 
260 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198252 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.53 
 
 
257 aa  318  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0441783  normal  0.700268 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.31 
 
 
258 aa  316  3e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.61 
 
 
259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2403  gluconate 5-dehydrogenase  58.14 
 
 
258 aa  300  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.525317  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.31 
 
 
257 aa  283  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.36 
 
 
258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.063344  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4004  gluconate 5-dehydrogenase  52.45 
 
 
267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2306  gluconate 5-dehydrogenase  52.87 
 
 
262 aa  251  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  49.2 
 
 
259 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  48.82 
 
 
260 aa  246  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.22 
 
 
257 aa  236  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000174096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 
257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  45.14 
 
 
259 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.88 
 
 
255 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000026464  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.89 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690053  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.51 
 
 
284 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.51 
 
 
284 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.46 
 
 
255 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
255 aa  192  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.157032 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
249 aa  192  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  41.73 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
257 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2389  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  41.18 
 
 
255 aa  187  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07750  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  40.93 
 
 
252 aa  187  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.370743 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
260 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379733  normal  0.717658 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05637  short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_4G13550)  39.38 
 
 
262 aa  178  7e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.35699  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  41.5 
 
 
254 aa  178  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1187  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
256 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.206395 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
254 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.16 
 
 
259 aa  176  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
255 aa  176  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3982  short chain dehydrogenase  39.77 
 
 
260 aa  175  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10306  predicted protein  39.46 
 
 
267 aa  175  9e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275208  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490392  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.68 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0083213  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.31 
 
 
265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222007  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1050  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 
253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.150046 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0949  gluconate 5-dehydrogenase  37.93 
 
 
264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000161447 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.63 
 
 
266 aa  172  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
257 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.605713  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  37.35 
 
 
257 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
264 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
254 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.46 
 
 
255 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
256 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.46 
 
 
255 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.46 
 
 
255 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05161  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  38.65 
 
 
249 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.426884  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
258 aa  168  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.31 
 
 
257 aa  168  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.105018 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46750  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
257 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.658343  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 
265 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.243411  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
263 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.993819  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20270  beta-ketoacyl reductase  40.31 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.483952 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.15 
 
 
258 aa  166  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000166105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
252 aa  166  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.34144  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04781  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  37.01 
 
 
249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.24 
 
 
244 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  37.94 
 
 
258 aa  165  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  37.35 
 
 
255 aa  164  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  37.89 
 
 
260 aa  165  9e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00784  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_1G14540)  40.23 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0453  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.4 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.465318  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.425244  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0593655  normal  0.256231 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29820  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  38.46 
 
 
261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.89 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_004310  BR0458  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.53 
 
 
245 aa  163  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0981  2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase, putative  38.8 
 
 
249 aa  163  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.53 
 
 
245 aa  163  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.82564  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0918  putative 2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase  38.8 
 
 
249 aa  163  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.311873  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0825  hypothetical protein  39.22 
 
 
258 aa  163  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
258 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0777  gluconate 5-dehydrogenase  38.89 
 
 
251 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618291  hitchhiker  0.00200145 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0571  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.53 
 
 
245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.653945  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192229  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05091  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  36.61 
 
 
249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>