More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29820 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_29820  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  100 
 
 
261 aa  523  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.59 
 
 
251 aa  243  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.56 
 
 
255 aa  236  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.39 
 
 
257 aa  229  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2411  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.69 
 
 
255 aa  224  8e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.4 
 
 
258 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.79 
 
 
256 aa  223  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.21 
 
 
255 aa  222  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.59 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  48.67 
 
 
265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.41 
 
 
255 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.01 
 
 
255 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.01 
 
 
255 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2695  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  46.51 
 
 
277 aa  210  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 
257 aa  210  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.242227  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.83 
 
 
256 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.83 
 
 
254 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.51 
 
 
271 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1513  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  46.51 
 
 
277 aa  208  8e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.729699 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  45.98 
 
 
255 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
269 aa  206  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 
264 aa  206  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
258 aa  206  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.47 
 
 
257 aa  203  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.83 
 
 
254 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.824888  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2363  Short-chain dehydrogenase/reductase  47.43 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.15 
 
 
261 aa  199  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.718128 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 
257 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563434  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0919  putative oxidoreductase  45.28 
 
 
257 aa  198  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.47 
 
 
256 aa  198  7.999999999999999e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 
255 aa  194  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  42.75 
 
 
257 aa  194  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.02 
 
 
258 aa  191  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.08 
 
 
239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07590  hypothetical protein similar to NADP-dependent mannitol dehydrogenase (Broad)  42.75 
 
 
266 aa  189  5e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46750  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.53 
 
 
257 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.658343  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
254 aa  189  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  44.44 
 
 
254 aa  188  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0293  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.19 
 
 
257 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38255  peroxisomal 2,4- dienoyl-CoA reductase, and sorbitol utilization protein  40.08 
 
 
282 aa  187  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
269 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725023  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
257 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.600374  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 
256 aa  186  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4511  gluconate 5-dehydrogenase  40.78 
 
 
254 aa  185  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.7 
 
 
253 aa  185  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.044107  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
257 aa  184  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0349  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.76 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  46.07 
 
 
254 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  40 
 
 
254 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.69 
 
 
254 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
257 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 
272 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.382394  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  41.96 
 
 
255 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 
269 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
255 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1763  gluconate 5-dehydrogenase  41.54 
 
 
260 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.401808  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
252 aa  180  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 
255 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  42.35 
 
 
256 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.36 
 
 
256 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  43.31 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.35 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2403  gluconate 5-dehydrogenase  41.15 
 
 
258 aa  179  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.525317  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
258 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  43.65 
 
 
261 aa  178  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_002620  TC0508  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.06 
 
 
248 aa  178  8e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
257 aa  178  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86346  peroxisomal 2,4- dienoyl-CoA reductase and sorbitol utilization protein  39.84 
 
 
285 aa  178  9e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1484  gluconate 5-dehydrogenase  40.77 
 
 
260 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0155973  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  39.22 
 
 
259 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0777  gluconate 5-dehydrogenase  44.14 
 
 
251 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618291  hitchhiker  0.00200145 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3288  gluconate 5-dehydrogenase  37.98 
 
 
254 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1443  gluconate 5-dehydrogenase  40.77 
 
 
260 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325951  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1409  gluconate 5-dehydrogenase  40.61 
 
 
260 aa  175  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
260 aa  175  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03312  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_6G13830)  40.93 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  39.06 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.46 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.34144  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  39.53 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1851  gluconate 5-dehydrogenase  38.7 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198252 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1576  gluconate 5-dehydrogenase  39.15 
 
 
289 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 
263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1470  gluconate 5-dehydrogenase  39.76 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3124  short chain dehydrogenase  40.46 
 
 
262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1800  gluconate 5-dehydrogenase  39.76 
 
 
254 aa  172  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5798  gluconate 5-dehydrogenase  43.53 
 
 
251 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  hitchhiker  0.00243591 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  44.71 
 
 
257 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0222  gluconate 5-dehydrogenase  39.22 
 
 
254 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2397  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  39.13 
 
 
254 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.52 
 
 
248 aa  171  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05340  d-arabinitol 2-dehydrogenase, putative  38.55 
 
 
355 aa  171  7.999999999999999e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.656485  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
256 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  40 
 
 
267 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>