More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND02410 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND02410  conserved hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  545  1e-154  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.167898  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05637  short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_4G13550)  55.94 
 
 
262 aa  300  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.35699  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000026464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.61 
 
 
260 aa  242  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379733  normal  0.717658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.4 
 
 
255 aa  238  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.1 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.157032 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.22 
 
 
258 aa  230  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.29 
 
 
260 aa  230  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.31 
 
 
257 aa  226  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 
284 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 
284 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 
284 aa  221  7e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690053  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1050  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.06 
 
 
253 aa  221  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.150046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
256 aa  221  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20270  beta-ketoacyl reductase  46.83 
 
 
256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.483952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
269 aa  215  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490392  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5272  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.95 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 
263 aa  210  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.993819  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.63 
 
 
268 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0330322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
258 aa  205  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
257 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
267 aa  203  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.223679  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
256 aa  202  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.24 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.105018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1187  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.206395 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.425244  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0751  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR)  44.23 
 
 
269 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.06 
 
 
268 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.79 
 
 
268 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal  0.73895 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 
260 aa  194  9e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0083213  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
259 aa  190  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 
256 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00784  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_1G14540)  39.1 
 
 
281 aa  175  7e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10306  predicted protein  38.31 
 
 
267 aa  170  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275208  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
258 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1409  gluconate 5-dehydrogenase  38.08 
 
 
260 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61314  peroxisomal 2,4- dienoyl-CoA reductase  36.05 
 
 
269 aa  151  8.999999999999999e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35804  normal  0.723211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1851  gluconate 5-dehydrogenase  37.26 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2919  gluconate 5-dehydrogenase  36.58 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  34.62 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08403  conserved hypothetical protein  37.55 
 
 
280 aa  146  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.706703  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2493  gluconate 5-dehydrogenase  36.19 
 
 
274 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1844  gluconate 5-dehydrogenase  37.74 
 
 
263 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250447  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  34.62 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2873  gluconate 5-dehydrogenase  35.41 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
254 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16609  predicted protein  37.34 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  36.58 
 
 
267 aa  136  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
257 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0441783  normal  0.700268 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1443  gluconate 5-dehydrogenase  35 
 
 
260 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325951  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2353  gluconate 5-dehydrogenase  35.41 
 
 
262 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
257 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1484  gluconate 5-dehydrogenase  34.62 
 
 
260 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0155973  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2403  gluconate 5-dehydrogenase  34.36 
 
 
258 aa  133  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.525317  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
257 aa  133  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000174096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1763  gluconate 5-dehydrogenase  34.23 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.401808  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  32.57 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3360  gluconate 5-dehydrogenase  35 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.319469  normal  0.757652 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2306  gluconate 5-dehydrogenase  33.71 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833457 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2008  gluconate 5-dehydrogenase  34.38 
 
 
263 aa  125  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1695  gluconate 5-dehydrogenase  34.38 
 
 
263 aa  125  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 
256 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0419778 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.01 
 
 
258 aa  124  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5135  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.8 
 
 
251 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
254 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17920  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  32.24 
 
 
251 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.355358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 
254 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.818797  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06274  short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_7G04540)  30.85 
 
 
345 aa  122  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0418357  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0994  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.61 
 
 
248 aa  122  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.931337 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 
258 aa  122  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.063344  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 
256 aa  122  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0123285 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0563  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 
252 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1800  gluconate 5-dehydrogenase  31.18 
 
 
254 aa  120  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1576  gluconate 5-dehydrogenase  31.18 
 
 
289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1470  gluconate 5-dehydrogenase  31.18 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
255 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
255 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
257 aa  119  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
255 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
251 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
251 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.265476  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
251 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282866  normal  0.301564 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.35 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.67 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 
257 aa  116  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
254 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597888  normal  0.281853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>