More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0099 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
257 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.68 
 
 
255 aa  287  9e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1050  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.43 
 
 
253 aa  285  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.150046 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.3 
 
 
255 aa  276  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000026464  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.69 
 
 
257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379733  normal  0.717658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.58 
 
 
255 aa  257  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.157032 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.49 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.15 
 
 
284 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690053  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.76 
 
 
284 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.76 
 
 
284 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.33 
 
 
258 aa  249  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.64 
 
 
256 aa  239  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.39 
 
 
267 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.223679  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.61 
 
 
256 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.51 
 
 
269 aa  228  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490392  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05637  short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_4G13550)  44.71 
 
 
262 aa  226  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.35699  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.54 
 
 
260 aa  226  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0083213  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
263 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.993819  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.66 
 
 
259 aa  219  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00784  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_1G14540)  46.39 
 
 
281 aa  217  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.64 
 
 
267 aa  216  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.425244  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20270  beta-ketoacyl reductase  46.27 
 
 
256 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.483952 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10306  predicted protein  46.3 
 
 
267 aa  214  8e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275208  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.03 
 
 
256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 
257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.105018 
 
 
-
 
NC_006686  CND02410  conserved hypothetical protein  42.29 
 
 
264 aa  209  3e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.167898  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.51 
 
 
268 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0330322 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.22 
 
 
268 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal  0.73895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.91 
 
 
258 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1187  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.206395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5272  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.42 
 
 
268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.67 
 
 
268 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.58 
 
 
258 aa  192  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2403  gluconate 5-dehydrogenase  42.8 
 
 
258 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.525317  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1844  gluconate 5-dehydrogenase  40.54 
 
 
263 aa  181  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250447  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2353  gluconate 5-dehydrogenase  40.77 
 
 
262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0751  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR)  45.74 
 
 
269 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  39.38 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  40.94 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0441783  normal  0.700268 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1443  gluconate 5-dehydrogenase  39.25 
 
 
260 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325951  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4004  gluconate 5-dehydrogenase  42.64 
 
 
267 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1484  gluconate 5-dehydrogenase  39.25 
 
 
260 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0155973  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
257 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2493  gluconate 5-dehydrogenase  39.45 
 
 
274 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  39.92 
 
 
260 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1763  gluconate 5-dehydrogenase  39.25 
 
 
260 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.401808  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.38 
 
 
258 aa  165  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.063344  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1409  gluconate 5-dehydrogenase  39.77 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1851  gluconate 5-dehydrogenase  39.23 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198252 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2873  gluconate 5-dehydrogenase  36.68 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000174096  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61314  peroxisomal 2,4- dienoyl-CoA reductase  37.55 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35804  normal  0.723211 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2919  gluconate 5-dehydrogenase  36.68 
 
 
264 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2306  gluconate 5-dehydrogenase  44.23 
 
 
262 aa  161  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833457 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08403  conserved hypothetical protein  39.34 
 
 
280 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.706703  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  39.69 
 
 
259 aa  159  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
254 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16609  predicted protein  45.1 
 
 
266 aa  157  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2008  gluconate 5-dehydrogenase  39.3 
 
 
263 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1695  gluconate 5-dehydrogenase  39.3 
 
 
263 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3288  gluconate 5-dehydrogenase  36.29 
 
 
254 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
259 aa  153  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3360  gluconate 5-dehydrogenase  37.88 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.319469  normal  0.757652 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
249 aa  152  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
252 aa  151  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
252 aa  149  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.04 
 
 
247 aa  145  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  40.08 
 
 
254 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.89 
 
 
248 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
256 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
266 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
254 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
266 aa  142  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
255 aa  141  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.58 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4263  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  36.12 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.7 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0222  gluconate 5-dehydrogenase  35.27 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.34 
 
 
247 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  37.21 
 
 
253 aa  138  7.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.11 
 
 
244 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1150  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.11 
 
 
256 aa  138  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
263 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 
252 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
249 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
257 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.51 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5273  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.47 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.246968  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
247 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.55 
 
 
245 aa  136  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.46 
 
 
246 aa  136  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
264 aa  135  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>