More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0802 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  100 
 
 
238 aa  475  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  46.53 
 
 
245 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 
245 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  47.21 
 
 
237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  48.51 
 
 
270 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  48.51 
 
 
240 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  48.51 
 
 
240 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  48.51 
 
 
240 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  48.51 
 
 
240 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  48.94 
 
 
240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  48.51 
 
 
240 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  48.31 
 
 
240 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.64 
 
 
234 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  45.49 
 
 
237 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2546  short chain dehydrogenase  39.57 
 
 
238 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  39.15 
 
 
238 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 
243 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3511  short chain dehydrogenase  45.69 
 
 
237 aa  169  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
238 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
237 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
246 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.28 
 
 
250 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
238 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  39.13 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.68 
 
 
238 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261739  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5080  short chain dehydrogenase  43.75 
 
 
240 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
238 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.996874 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
238 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  44.07 
 
 
237 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  44.4 
 
 
237 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  44.07 
 
 
237 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  45.6 
 
 
204 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.76 
 
 
245 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  43.2 
 
 
236 aa  155  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3326  short chain dehydrogenase  46.4 
 
 
246 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.76 
 
 
245 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.76 
 
 
245 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3131  short chain dehydrogenase  47.3 
 
 
250 aa  148  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3239  short chain dehydrogenase  45.95 
 
 
245 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161967  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213287  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.5 
 
 
248 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.67 
 
 
259 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 
239 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0910719 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.76 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
205 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2086  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 
245 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879174  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
237 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00951861 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.129059  normal  0.0371904 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 
256 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 
256 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 
256 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.89 
 
 
258 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0938  Short-chain alcohol dehydrogenase  28.22 
 
 
242 aa  123  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746042  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
256 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.63 
 
 
246 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0908  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09158  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01040)  32.63 
 
 
251 aa  119  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.08 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.34 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
258 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
246 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.87063  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.17 
 
 
249 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 
274 aa  115  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
247 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 
249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.731962 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237096  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 
249 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
249 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
248 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.57 
 
 
249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
253 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1223  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.48 
 
 
254 aa  112  7.000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3870  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
259 aa  111  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 
251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 
248 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
258 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.51 
 
 
249 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
251 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195862  normal  0.0790399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 
250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178031  hitchhiker  0.00135629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
247 aa  109  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.466284  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 
247 aa  108  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170214  normal  0.189904 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  33.06 
 
 
248 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
258 aa  107  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
267 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 
244 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.317025 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
249 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
249 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
257 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 
276 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
261 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
242 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>