More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2386 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
238 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2546  short chain dehydrogenase  91.6 
 
 
238 aa  455  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  90.34 
 
 
238 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  38.82 
 
 
238 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
250 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.29 
 
 
246 aa  140  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  36.95 
 
 
245 aa  138  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.996874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 
241 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  32.2 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  32.2 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  32.63 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261739  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  32.2 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  32.2 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  32.2 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3511  short chain dehydrogenase  35.62 
 
 
237 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  32.2 
 
 
240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 
234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  31.76 
 
 
237 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  32.63 
 
 
237 aa  118  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2086  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.36 
 
 
245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879174  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  34.45 
 
 
236 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  32.09 
 
 
222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.7 
 
 
239 aa  108  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0910719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 
237 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
250 aa  106  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
238 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 
240 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
258 aa  105  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
247 aa  105  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  32.89 
 
 
237 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
237 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00951861 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 
237 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.129059  normal  0.0371904 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
238 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 
237 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 
237 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0938  Short-chain alcohol dehydrogenase  30.74 
 
 
242 aa  100  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  30.3 
 
 
204 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170214  normal  0.189904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5080  short chain dehydrogenase  34.31 
 
 
240 aa  95.5  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.31 
 
 
250 aa  94  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.64 
 
 
245 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 
246 aa  92.8  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 
255 aa  92.4  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 
248 aa  91.7  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213287  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.51 
 
 
244 aa  92  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0174696 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09158  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01040)  30.54 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.62 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.89 
 
 
244 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000275266  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3326  short chain dehydrogenase  33.06 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.58 
 
 
256 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
250 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.31 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3239  short chain dehydrogenase  30.59 
 
 
245 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161967  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.92 
 
 
250 aa  88.6  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 
256 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.945101  normal  0.897274 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.317025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.991587  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.99 
 
 
249 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 
247 aa  85.9  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.466284  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.42 
 
 
253 aa  85.5  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
258 aa  85.1  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 
246 aa  85.1  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.65 
 
 
246 aa  85.1  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3131  short chain dehydrogenase  33.06 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.99 
 
 
245 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.99 
 
 
245 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.8 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2972  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2783  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.82 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335841  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.74 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  29.92 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.19 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1510  short chain dehydrogenase  27.73 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.24 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1440  short chain dehydrogenase  31.17 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0816082  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.35 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5639  short chain dehydrogenase  31.23 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308131  hitchhiker  0.00207751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.35 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4730  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  30.98 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.22 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.442854  normal  0.93857 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.35 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71611  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.5 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.93 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3574  short chain dehydrogenase  29.48 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11528  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000312486  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.83 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.872863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>