More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3131 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3131  short chain dehydrogenase  100 
 
 
250 aa  474  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3326  short chain dehydrogenase  97.97 
 
 
246 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3239  short chain dehydrogenase  96.75 
 
 
245 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161967  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  55.74 
 
 
245 aa  242  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  55.32 
 
 
245 aa  241  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.19 
 
 
243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5080  short chain dehydrogenase  53.33 
 
 
240 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  49.16 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3511  short chain dehydrogenase  49.15 
 
 
237 aa  178  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.77 
 
 
237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  43.75 
 
 
236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 
237 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  41.42 
 
 
270 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  41.1 
 
 
240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  41.1 
 
 
240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  41.1 
 
 
240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  41.1 
 
 
240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  41.95 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  39.32 
 
 
237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  41.95 
 
 
240 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.68 
 
 
250 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 
238 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  43.16 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.5 
 
 
259 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2546  short chain dehydrogenase  32.92 
 
 
238 aa  139  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
238 aa  138  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261739  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.61 
 
 
238 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.996874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 
246 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.5 
 
 
241 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 
237 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  43.65 
 
 
204 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 
238 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
238 aa  131  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.71 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  32.63 
 
 
222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
248 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213287  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
245 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.45 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0910719 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2086  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
245 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879174  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
237 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00951861 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
245 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
245 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.129059  normal  0.0371904 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
250 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0696  glucose 1-dehydrogenase  36.63 
 
 
252 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 
256 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0938  Short-chain alcohol dehydrogenase  27.8 
 
 
242 aa  109  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746042  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 
256 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 
250 aa  108  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
249 aa  108  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
256 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3225  bacilysin biosynthesis oxidoreductase BacC  35.68 
 
 
242 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
248 aa  108  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.92 
 
 
247 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.466284  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09158  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01040)  32.64 
 
 
251 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
247 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2267  putative short-chain dehydrogenase  34.68 
 
 
292 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
246 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
254 aa  105  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000027503  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.52 
 
 
251 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
250 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
250 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
249 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26730  putative short-chain dehydrogenase  34.27 
 
 
292 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.4 
 
 
249 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 
249 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
205 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
249 aa  102  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
248 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
252 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.87063  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.97 
 
 
258 aa  101  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
253 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
249 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.731962 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
249 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13982  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
249 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 
255 aa  99.8  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
252 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  35.22 
 
 
251 aa  99.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3946  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
289 aa  99  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0291  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.2 
 
 
286 aa  99  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
249 aa  98.6  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  31.05 
 
 
248 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1148  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.66 
 
 
323 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 
247 aa  97.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.991587  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2928  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.66 
 
 
286 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458345  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2773  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.66 
 
 
286 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
244 aa  98.2  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0923902  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
248 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1040  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
231 aa  97.8  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.268207  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
248 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.08 
 
 
258 aa  97.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.663609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>