More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3511 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3511  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 237 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  67.92 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  67.92 
 
 		 270 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  67.92 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  67.92 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  67.92 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  68.75 
 
 		 240 aa  288  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  68.75 
 
 		 240 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  68.33 
 
 		 240 aa  284  8e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  62.03 
 
 		 237 aa  277  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  63.68 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  65.11 
 
 		 236 aa  265  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  65.38 
 
 		 237 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  65.38 
 
 		 237 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  65.38 
 
 		 237 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  65.37 
 
 		 204 aa  251  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  45.69 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  43.7 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  41.35 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 		 250 aa  155  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.07 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2546  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 		 243 aa  141  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  36.24 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3326  short chain dehydrogenase  47.44 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 237 aa  138  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3239  short chain dehydrogenase  47.01 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 238 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261739  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 		 248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.996874 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3131  short chain dehydrogenase  48.29 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 		 234 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.42 
 
 		 259 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 		 237 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951861 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 		 237 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.129059  normal  0.0371904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5080  short chain dehydrogenase  41.95 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2086  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.32 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879174  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 		 244 aa  118  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.28 
 
 		 248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0910719 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 		 249 aa  108  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09158  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01040)  34.73 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0938  Short-chain alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 		 249 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.22 
 
 		 249 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.487626 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 274 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1758  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 		 270 aa  95.5  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.259984  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 		 249 aa  95.5  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0142  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 		 255 aa  95.1  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.85 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.72 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.466284  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1982  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000445056  unclonable  0.000000000077368 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0308  putative short-chain dehydrogenase/reductase  38.31 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 250 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.94 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2049  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 275 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0464745  hitchhiker  0.000360099 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.27 
 
 		 244 aa  93.2  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 		 256 aa  92.8  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472606 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1741  short chain dehydrogenase  32.53 
 
 		 272 aa  92.4  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00532384  hitchhiker  0.00268823 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 		 260 aa  92.4  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100274  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2078  short chain dehydrogenase  32 
 
 		 268 aa  92  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237078  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2037  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0153445  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1929  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 265 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000156385  unclonable  0.0000000000437203 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.731962 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1959  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 271 aa  90.5  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  hitchhiker  0.00037769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 		 250 aa  90.1  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.1 
 
 		 251 aa  89.7  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2274  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 273 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000319086  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2075  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 273 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000264648  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  30.83 
 
 		 249 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2391  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00010416  unclonable  0.0000108368 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 		 245 aa  89.4  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12220  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>