More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1741 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1741  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 272 aa  544  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00532384  hitchhiker  0.00268823 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1758  short chain dehydrogenase  72.12 
 
 		 270 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.259984  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2118  short chain dehydrogenase  70.9 
 
 		 280 aa  376  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000143066  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1982  short chain dehydrogenase  70.74 
 
 		 275 aa  374  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000445056  unclonable  0.000000000077368 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2397  short chain dehydrogenase  71.91 
 
 		 275 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2049  short chain dehydrogenase  70.74 
 
 		 275 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0464745  hitchhiker  0.000360099 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2071  short chain dehydrogenase  71.91 
 
 		 273 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00111484  unclonable  0.00000000000219735 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2274  short chain dehydrogenase  71.91 
 
 		 273 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000319086  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2075  short chain dehydrogenase  71.91 
 
 		 273 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000264648  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2391  short chain dehydrogenase  71.16 
 
 		 273 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00010416  unclonable  0.0000108368 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1959  short chain dehydrogenase  68.54 
 
 		 271 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  hitchhiker  0.00037769 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2037  short chain dehydrogenase  71.16 
 
 		 273 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0153445  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1929  short chain dehydrogenase  72.31 
 
 		 265 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000156385  unclonable  0.0000000000437203 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2078  short chain dehydrogenase  67.91 
 
 		 268 aa  359  3e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237078  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2377  short chain dehydrogenase  57.68 
 
 		 273 aa  307  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.8 
 
 		 268 aa  261  6e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233073 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.8 
 
 		 268 aa  261  6.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.430043  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 		 275 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1203  short chain dehydrogenase  53.46 
 
 		 271 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1566  short chain dehydrogenase  49.4 
 
 		 267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0146  short chain dehydrogenase  51.5 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3281  short chain dehydrogenase  49.2 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1031  short chain dehydrogenase  51 
 
 		 263 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0687458 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3071  short chain dehydrogenase  46.59 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1336  short chain dehydrogenase  47.2 
 
 		 263 aa  204  9e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341301  normal  0.0949084 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5509  putative 2,4-dienoyl-CoA reductase (NADPH)  52 
 
 		 191 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57591  predicted protein  42.4 
 
 		 288 aa  172  7.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.64 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2692  short chain dehydrogenase  40.09 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3748  short chain dehydrogenase  40.09 
 
 		 256 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4095  short chain dehydrogenase  40.52 
 
 		 256 aa  159  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1145  short chain dehydrogenase  40.52 
 
 		 256 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4112  short chain dehydrogenase  39.66 
 
 		 254 aa  158  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4040  short chain dehydrogenase  39.66 
 
 		 254 aa  158  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0939  short chain dehydrogenase  39.52 
 
 		 254 aa  158  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3819  short chain dehydrogenase  40.61 
 
 		 264 aa  158  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4007  short chain dehydrogenase  40.09 
 
 		 256 aa  158  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3900  short chain dehydrogenase  40.09 
 
 		 254 aa  158  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4204  short chain dehydrogenase  40.09 
 
 		 254 aa  158  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982997  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03790  2,4-dienoyl-CoA reductase, putative  41.3 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.128522  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3732  short chain dehydrogenase  40.09 
 
 		 254 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 		 282 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0891264  normal  0.29276 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07770  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G07470)  36.73 
 
 		 315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0479246 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45705  predicted protein  39.69 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 		 259 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07120  2, 4-dienoyl-CoA reductase (NADPH) precursor related protein  37.55 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1818  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0877  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1794  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.23 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11319  peroxisomal 2,4-dienoyl-CoA reductase  37.41 
 
 		 296 aa  138  8.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.184472  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 		 284 aa  135  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.374881  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1394  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 306 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560353  normal  0.490108 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 		 289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.12909  normal  0.769713 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6091  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 		 260 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50583  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2928  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.4 
 
 		 286 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458345  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2773  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.4 
 
 		 286 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 		 295 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1148  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.4 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0291  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 260 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0105  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 		 295 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0563  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 		 252 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1154  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  34.43 
 
 		 253 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000294561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0991  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  34.57 
 
 		 253 aa  125  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  31.44 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.913032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2267  putative short-chain dehydrogenase  32.94 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5205  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00959428  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  30.52 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37372  predicted protein  33.47 
 
 		 289 aa  123  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26730  putative short-chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 286 aa  122  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189281 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1839  glucose 1-dehydrogenase  31.03 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0372378  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.473895  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.73 
 
 		 247 aa  122  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 		 266 aa  122  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.499955 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11580  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.499574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1843  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.41 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136671  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4263  gluconate 5-dehydrogenase  30.4 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2742  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0442377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>