More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5261 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
298 aa  611  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5205  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.55 
 
 
294 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00959428  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.82 
 
 
292 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.278659  normal  0.743935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0105  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.75 
 
 
295 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.28 
 
 
295 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245177  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.95 
 
 
294 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.24 
 
 
304 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.76 
 
 
306 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.19 
 
 
288 aa  365  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1394  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.72 
 
 
306 aa  363  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560353  normal  0.490108 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3946  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.24 
 
 
289 aa  362  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.89 
 
 
289 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.12909  normal  0.769713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2267  putative short-chain dehydrogenase  60.07 
 
 
292 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26730  putative short-chain dehydrogenase  59.86 
 
 
292 aa  346  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2773  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  60.49 
 
 
286 aa  338  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2928  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  60.49 
 
 
286 aa  338  7e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458345  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1148  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  60.49 
 
 
323 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0291  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  59.15 
 
 
286 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.12 
 
 
290 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.07 
 
 
282 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0891264  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37372  predicted protein  45.49 
 
 
289 aa  202  6e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
308 aa  182  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 
286 aa  179  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.189281 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
264 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
269 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
292 aa  166  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.499574  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 
287 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.913032  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0939  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 
254 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1818  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 
255 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0265  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.8 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
284 aa  152  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.374881  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
255 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 
290 aa  149  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.518132  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.197864  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.89 
 
 
246 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.89 
 
 
246 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.95 
 
 
293 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
256 aa  143  4e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0964408  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0146  short chain dehydrogenase  37.3 
 
 
277 aa  143  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 
296 aa  142  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
256 aa  142  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.31 
 
 
247 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  34.54 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3819  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1959  short chain dehydrogenase  34.41 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  hitchhiker  0.00037769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.15 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
256 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3900  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
254 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3732  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
254 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2692  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 
254 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445957  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3281  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 
266 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4204  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
254 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4007  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
256 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
258 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  33.99 
 
 
259 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4040  short chain dehydrogenase  37.96 
 
 
254 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.69 
 
 
250 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3748  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  36.69 
 
 
250 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4112  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
252 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1145  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
256 aa  139  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4095  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
256 aa  139  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.55 
 
 
247 aa  139  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
259 aa  139  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
268 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.430043  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 
294 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432836  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
268 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.233073 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.18 
 
 
246 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
256 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
257 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000174096  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
257 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.01 
 
 
245 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0797  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.1 
 
 
244 aa  136  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
251 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2263  short chain dehydrogenase  35.16 
 
 
255 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00829126  normal  0.0703688 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1758  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 
270 aa  136  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.259984  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1837  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.41 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000200406  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2039  short chain dehydrogenase  35.94 
 
 
255 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111409  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.6 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.94 
 
 
248 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.96 
 
 
245 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0908  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.94 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1043  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.63 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00108019  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.44 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0167  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.22 
 
 
245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.619009  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.01 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0197  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.41 
 
 
245 aa  133  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.39 
 
 
246 aa  133  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0264  putative short-chain dehydrogenase  36.84 
 
 
262 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  35.57 
 
 
257 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.894165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>