More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0877 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0877  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 303 aa  610  9.999999999999999e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5227  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.77 
 
 		 302 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 264 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.53 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.87 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.31 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07120  2, 4-dienoyl-CoA reductase (NADPH) precursor related protein  41.25 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1818  short chain dehydrogenase  42.4 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0939  short chain dehydrogenase  40.56 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 		 284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.374881  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2628  2, 4-dienoyl-CoA reductase (NADPH)-related protein  43.04 
 
 		 291 aa  182  6e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.346863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3819  short chain dehydrogenase  40.78 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3900  short chain dehydrogenase  40.73 
 
 		 254 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3732  short chain dehydrogenase  40.73 
 
 		 254 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4204  short chain dehydrogenase  40.73 
 
 		 254 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4007  short chain dehydrogenase  40.73 
 
 		 256 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4040  short chain dehydrogenase  41.13 
 
 		 254 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3748  short chain dehydrogenase  40.73 
 
 		 256 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1145  short chain dehydrogenase  41.13 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4095  short chain dehydrogenase  41.13 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2692  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 		 254 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445957  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4112  short chain dehydrogenase  40.73 
 
 		 254 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233073 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1148  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.57 
 
 		 323 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.430043  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 		 294 aa  168  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2928  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.94 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458345  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2773  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.94 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0291  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  41.94 
 
 		 286 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204031 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 		 259 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.12909  normal  0.769713 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2377  short chain dehydrogenase  39.85 
 
 		 273 aa  162  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1758  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.259984  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 285 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  0.0141735 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1959  short chain dehydrogenase  39.22 
 
 		 271 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  hitchhiker  0.00037769 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 275 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 		 282 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0891264  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2078  short chain dehydrogenase  37.25 
 
 		 268 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237078  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2049  short chain dehydrogenase  39.04 
 
 		 275 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0464745  hitchhiker  0.000360099 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 		 256 aa  155  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189281 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2397  short chain dehydrogenase  39.44 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2391  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00010416  unclonable  0.0000108368 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.913032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1929  short chain dehydrogenase  39.68 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000156385  unclonable  0.0000000000437203 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1203  short chain dehydrogenase  40.42 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1982  short chain dehydrogenase  38.65 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000445056  unclonable  0.000000000077368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 		 258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0450  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2267  putative short-chain dehydrogenase  37.15 
 
 		 292 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2118  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 		 280 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000143066  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2037  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0153445  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0964408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1741  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00532384  hitchhiker  0.00268823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0105  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 		 295 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2071  short chain dehydrogenase  37.25 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00111484  unclonable  0.00000000000219735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2075  short chain dehydrogenase  37.05 
 
 		 273 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000264648  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2274  short chain dehydrogenase  37.05 
 
 		 273 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000319086  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3946  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 289 aa  149  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26730  putative short-chain dehydrogenase  35.97 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.06 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.499574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 		 295 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1566  short chain dehydrogenase  37.21 
 
 		 267 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5205  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00959428  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3071  short chain dehydrogenase  39.04 
 
 		 264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1394  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560353  normal  0.490108 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0403  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 		 278 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19413  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 		 306 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0146  short chain dehydrogenase  40.5 
 
 		 277 aa  141  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3281  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1336  short chain dehydrogenase  38.61 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341301  normal  0.0949084 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 		 257 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 		 255 aa  138  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.278659  normal  0.743935 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1031  short chain dehydrogenase  39.22 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0687458 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13073  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein  37.45 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 259 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192229  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.08 
 
 		 258 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000166105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0129049  hitchhiker  0.0000238607 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 		 253 aa  136  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.381753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.15 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2925  putative oxidoreductase  38.19 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57591  predicted protein  35.57 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 		 286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.961731  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>