More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3071 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3071  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 264 aa  535  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1336  short chain dehydrogenase  73.66 
 
 		 263 aa  369  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341301  normal  0.0949084 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3281  short chain dehydrogenase  64.73 
 
 		 266 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1566  short chain dehydrogenase  58.98 
 
 		 267 aa  290  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1031  short chain dehydrogenase  58.82 
 
 		 263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0687458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.22 
 
 		 268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.430043  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.22 
 
 		 268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233073 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0146  short chain dehydrogenase  52.99 
 
 		 277 aa  234  8e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.44 
 
 		 275 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1982  short chain dehydrogenase  49.2 
 
 		 275 aa  223  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000445056  unclonable  0.000000000077368 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1959  short chain dehydrogenase  47.6 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  hitchhiker  0.00037769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2049  short chain dehydrogenase  49.6 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0464745  hitchhiker  0.000360099 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1741  short chain dehydrogenase  46.59 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00532384  hitchhiker  0.00268823 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2037  short chain dehydrogenase  49.2 
 
 		 273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0153445  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2274  short chain dehydrogenase  48.8 
 
 		 273 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000319086  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2075  short chain dehydrogenase  48.8 
 
 		 273 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000264648  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2391  short chain dehydrogenase  48.4 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00010416  unclonable  0.0000108368 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2118  short chain dehydrogenase  47.2 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000143066  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1929  short chain dehydrogenase  49.2 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000156385  unclonable  0.0000000000437203 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2071  short chain dehydrogenase  48 
 
 		 273 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00111484  unclonable  0.00000000000219735 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2397  short chain dehydrogenase  48 
 
 		 275 aa  214  9e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1758  short chain dehydrogenase  46.83 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.259984  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2078  short chain dehydrogenase  46.8 
 
 		 268 aa  211  9e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237078  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1203  short chain dehydrogenase  48.36 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2377  short chain dehydrogenase  46.06 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5509  putative 2,4-dienoyl-CoA reductase (NADPH)  53.33 
 
 		 191 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57591  predicted protein  39.62 
 
 		 288 aa  173  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770951  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03790  2,4-dienoyl-CoA reductase, putative  40.32 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.128522  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45705  predicted protein  40.31 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07770  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G07470)  37.04 
 
 		 315 aa  156  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0479246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 		 308 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 		 284 aa  142  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.374881  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 		 293 aa  142  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11319  peroxisomal 2,4-dienoyl-CoA reductase  40.84 
 
 		 296 aa  142  6e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.184472  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0939  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07120  2, 4-dienoyl-CoA reductase (NADPH) precursor related protein  34.72 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1818  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3946  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0877  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37372  predicted protein  33.72 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189281 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0291  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.86 
 
 		 286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 		 251 aa  128  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 		 288 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3900  short chain dehydrogenase  35.22 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3732  short chain dehydrogenase  35.22 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2267  putative short-chain dehydrogenase  34.21 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4204  short chain dehydrogenase  35.22 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982997  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26730  putative short-chain dehydrogenase  34.21 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4007  short chain dehydrogenase  35.22 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3748  short chain dehydrogenase  35.22 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2773  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.86 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2928  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.86 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3819  short chain dehydrogenase  35.22 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1148  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.86 
 
 		 323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2692  short chain dehydrogenase  34.35 
 
 		 254 aa  125  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4040  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4112  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.48 
 
 		 289 aa  125  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.12909  normal  0.769713 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 		 294 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0105  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 295 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1145  short chain dehydrogenase  34.35 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.499574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0891264  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4095  short chain dehydrogenase  34.35 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 287 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.913032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 294 aa  122  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 262 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.91 
 
 		 282 aa  122  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204031 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 		 296 aa  122  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1462  short chain dehydrogenase  34.66 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780505  normal  0.472933 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3531  short chain dehydrogenase  34.16 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 		 249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 249 aa  119  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 		 252 aa  119  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1510  short chain dehydrogenase  36.07 
 
 		 249 aa  118  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.06 
 
 		 247 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2628  2, 4-dienoyl-CoA reductase (NADPH)-related protein  33.62 
 
 		 291 aa  117  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.346863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01070  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.15 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256883 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7235  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 251 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 		 257 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>