More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2075 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2075  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 273 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000264648  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2274  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 273 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000319086  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2071  short chain dehydrogenase  98.17 
 
 		 273 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00111484  unclonable  0.00000000000219735 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2391  short chain dehydrogenase  98.17 
 
 		 273 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00010416  unclonable  0.0000108368 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2037  short chain dehydrogenase  94.51 
 
 		 273 aa  522  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0153445  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2049  short chain dehydrogenase  90.44 
 
 		 275 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0464745  hitchhiker  0.000360099 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2397  short chain dehydrogenase  89.71 
 
 		 275 aa  497  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1982  short chain dehydrogenase  89.71 
 
 		 275 aa  499  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000445056  unclonable  0.000000000077368 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1929  short chain dehydrogenase  90.19 
 
 		 265 aa  487  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000156385  unclonable  0.0000000000437203 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1758  short chain dehydrogenase  83.52 
 
 		 270 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.259984  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2118  short chain dehydrogenase  81.55 
 
 		 280 aa  441  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000143066  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1959  short chain dehydrogenase  76.23 
 
 		 271 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  hitchhiker  0.00037769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2078  short chain dehydrogenase  76.4 
 
 		 268 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237078  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1741  short chain dehydrogenase  71.91 
 
 		 272 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00532384  hitchhiker  0.00268823 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2377  short chain dehydrogenase  59.61 
 
 		 273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.29 
 
 		 268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.430043  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.78 
 
 		 268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233073 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.94 
 
 		 275 aa  265  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1203  short chain dehydrogenase  51.15 
 
 		 271 aa  255  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0146  short chain dehydrogenase  52.99 
 
 		 277 aa  246  4e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3281  short chain dehydrogenase  48.4 
 
 		 266 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1566  short chain dehydrogenase  45.95 
 
 		 267 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1031  short chain dehydrogenase  49.22 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0687458 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3071  short chain dehydrogenase  48.8 
 
 		 264 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1336  short chain dehydrogenase  48.67 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341301  normal  0.0949084 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5509  putative 2,4-dienoyl-CoA reductase (NADPH)  50 
 
 		 191 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57591  predicted protein  44.4 
 
 		 288 aa  186  3e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07770  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G07470)  38.1 
 
 		 315 aa  169  6e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0479246 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45705  predicted protein  40.08 
 
 		 292 aa  168  8e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.48 
 
 		 259 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1818  short chain dehydrogenase  41.53 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03790  2,4-dienoyl-CoA reductase, putative  40 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.128522  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3819  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 		 264 aa  161  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2692  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 254 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445957  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0939  short chain dehydrogenase  39.68 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3900  short chain dehydrogenase  40.52 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4204  short chain dehydrogenase  40.52 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4007  short chain dehydrogenase  40.52 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3732  short chain dehydrogenase  40.52 
 
 		 254 aa  159  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3748  short chain dehydrogenase  40.52 
 
 		 256 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4040  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 		 254 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1145  short chain dehydrogenase  40.09 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4095  short chain dehydrogenase  40.09 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4112  short chain dehydrogenase  40.09 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11319  peroxisomal 2,4-dienoyl-CoA reductase  38.32 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.184472  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 		 269 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07120  2, 4-dienoyl-CoA reductase (NADPH) precursor related protein  34.94 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 293 aa  146  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.06 
 
 		 283 aa  143  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432836  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.2 
 
 		 254 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0891264  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1794  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.29 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0877  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 		 303 aa  139  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 		 243 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212781  normal  0.926969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.374881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 		 254 aa  135  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 252 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 		 282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204031 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1843  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.03 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136671  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 296 aa  132  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 256 aa  132  6e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0964408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0563  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37372  predicted protein  33.33 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1394  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560353  normal  0.490108 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  0.0141735 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.77 
 
 		 251 aa  129  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 252 aa  129  7.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3946  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11580  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.27 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.913032  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1839  glucose 1-dehydrogenase  32.26 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0372378  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1872  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.82 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.105262 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0659  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.43 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.372694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1154  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  34.02 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000294561  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 		 249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00384997  hitchhiker  0.000208801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2628  2, 4-dienoyl-CoA reductase (NADPH)-related protein  35.22 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.346863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 		 257 aa  125  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 		 258 aa  126  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5205  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 		 294 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00959428  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 308 aa  125  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0991  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  34.02 
 
 		 253 aa  125  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 		 256 aa  125  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.68 
 
 		 246 aa  125  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.68 
 
 		 246 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>