More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11319 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_11319  peroxisomal 2,4-dienoyl-CoA reductase  100 
 
 
296 aa  603  9.999999999999999e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.184472  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.96 
 
 
268 aa  188  9e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.233073 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
268 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.430043  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1758  short chain dehydrogenase  39.64 
 
 
270 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.259984  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1959  short chain dehydrogenase  38.18 
 
 
271 aa  175  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  hitchhiker  0.00037769 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2118  short chain dehydrogenase  39.64 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000143066  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0146  short chain dehydrogenase  42.8 
 
 
277 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2071  short chain dehydrogenase  37.96 
 
 
273 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00111484  unclonable  0.00000000000219735 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2274  short chain dehydrogenase  38.32 
 
 
273 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000319086  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2049  short chain dehydrogenase  38.04 
 
 
275 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0464745  hitchhiker  0.000360099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2075  short chain dehydrogenase  38.32 
 
 
273 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000264648  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1982  short chain dehydrogenase  37.68 
 
 
275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000445056  unclonable  0.000000000077368 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2391  short chain dehydrogenase  37.96 
 
 
273 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00010416  unclonable  0.0000108368 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1929  short chain dehydrogenase  39.53 
 
 
265 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000156385  unclonable  0.0000000000437203 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03790  2,4-dienoyl-CoA reductase, putative  37.78 
 
 
289 aa  159  5e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.128522  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2037  short chain dehydrogenase  36.5 
 
 
273 aa  159  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0153445  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3281  short chain dehydrogenase  37.74 
 
 
266 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3071  short chain dehydrogenase  41.22 
 
 
264 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2397  short chain dehydrogenase  37 
 
 
275 aa  156  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1566  short chain dehydrogenase  35.09 
 
 
267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.15 
 
 
259 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770951  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.21 
 
 
275 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1031  short chain dehydrogenase  38.2 
 
 
263 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0687458 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1741  short chain dehydrogenase  37.41 
 
 
272 aa  152  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00532384  hitchhiker  0.00268823 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2377  short chain dehydrogenase  39.22 
 
 
273 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2078  short chain dehydrogenase  35.9 
 
 
268 aa  149  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237078  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57591  predicted protein  35.5 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0939  short chain dehydrogenase  34.22 
 
 
254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 
264 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1336  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 
263 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341301  normal  0.0949084 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1818  short chain dehydrogenase  36.12 
 
 
255 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1203  short chain dehydrogenase  37.94 
 
 
271 aa  142  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354436  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45705  predicted protein  35.11 
 
 
292 aa  139  7e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.63 
 
 
294 aa  135  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432836  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.12909  normal  0.769713 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07770  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G07470)  33.8 
 
 
315 aa  133  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0479246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3819  short chain dehydrogenase  38.2 
 
 
264 aa  133  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
269 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.44 
 
 
291 aa  129  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3900  short chain dehydrogenase  36.54 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4095  short chain dehydrogenase  35.38 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4204  short chain dehydrogenase  36.54 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982997  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1145  short chain dehydrogenase  35.38 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4007  short chain dehydrogenase  36.54 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3732  short chain dehydrogenase  36.54 
 
 
254 aa  126  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3748  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 
256 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
294 aa  126  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.85 
 
 
282 aa  126  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0891264  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4040  short chain dehydrogenase  35.62 
 
 
254 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 
284 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.374881  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4112  short chain dehydrogenase  35.38 
 
 
254 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26730  putative short-chain dehydrogenase  31.95 
 
 
292 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2692  short chain dehydrogenase  34.23 
 
 
254 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445957  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 
293 aa  123  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
260 aa  123  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0403  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
278 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19413  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
296 aa  122  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2267  putative short-chain dehydrogenase  31.2 
 
 
292 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0877  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 
303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5205  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
294 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00959428  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
252 aa  119  9e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204031 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
247 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0105  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37372  predicted protein  32.45 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  32.69 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0291  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.96 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.913032  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.32 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.499574  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5509  putative 2,4-dienoyl-CoA reductase (NADPH)  37.29 
 
 
191 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1154  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  30.71 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000294561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0991  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  30.71 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
295 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245177  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 
256 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.82 
 
 
248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.46 
 
 
292 aa  115  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.278659  normal  0.743935 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
304 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.68 
 
 
247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07120  2, 4-dienoyl-CoA reductase (NADPH) precursor related protein  30.94 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  0.0141735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000468902  normal  0.0104317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
253 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.246968  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3946  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
289 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
308 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2628  2, 4-dienoyl-CoA reductase (NADPH)-related protein  32.34 
 
 
291 aa  112  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.346863  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
249 aa  112  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00384997  hitchhiker  0.000208801 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0948  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.5 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000118605  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0450  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10442  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2928  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.09 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458345  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1148  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.2 
 
 
323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2773  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.09 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.6 
 
 
297 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3749  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 
254 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 
252 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 
254 aa  109  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
266 aa  109  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 
254 aa  109  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>