More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2628 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2628  2, 4-dienoyl-CoA reductase (NADPH)-related protein  100 
 
 		 291 aa  591  1e-168  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.346863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.9 
 
 		 291 aa  386  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.38 
 
 		 293 aa  383  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.21 
 
 		 294 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.28 
 
 		 296 aa  360  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07120  2, 4-dienoyl-CoA reductase (NADPH) precursor related protein  58.97 
 
 		 294 aa  358  5e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.61 
 
 		 284 aa  317  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.374881  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.87 
 
 		 282 aa  305  6e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204031 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.16 
 
 		 285 aa  304  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  0.0141735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.12 
 
 		 285 aa  264  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.961731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0939  short chain dehydrogenase  49 
 
 		 254 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1818  short chain dehydrogenase  46.83 
 
 		 255 aa  235  6e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0403  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.96 
 
 		 278 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19413  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0450  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.04 
 
 		 296 aa  223  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.95 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.84 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2925  putative oxidoreductase  42.26 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 		 290 aa  198  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215015  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55778  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3819  short chain dehydrogenase  44.83 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3900  short chain dehydrogenase  44.92 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4204  short chain dehydrogenase  44.92 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4007  short chain dehydrogenase  45.1 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3748  short chain dehydrogenase  45.1 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3732  short chain dehydrogenase  44.92 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.14 
 
 		 301 aa  192  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0129049  hitchhiker  0.0000238607 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4040  short chain dehydrogenase  44.92 
 
 		 254 aa  192  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4095  short chain dehydrogenase  45.1 
 
 		 256 aa  192  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1145  short chain dehydrogenase  45.1 
 
 		 256 aa  192  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4112  short chain dehydrogenase  44.53 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2692  short chain dehydrogenase  44.53 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445957  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1677  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 		 290 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2230  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 269 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0877  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233073 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.430043  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 256 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1203  short chain dehydrogenase  37.25 
 
 		 271 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0146  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 277 aa  153  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1982  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 		 275 aa  149  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000445056  unclonable  0.000000000077368 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36 
 
 		 246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 		 275 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.913032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.6 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  34.57 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  33.83 
 
 		 260 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3281  short chain dehydrogenase  33.97 
 
 		 266 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1566  short chain dehydrogenase  33.72 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1031  short chain dehydrogenase  36.64 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0687458 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03790  2,4-dienoyl-CoA reductase, putative  34.38 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.128522  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2377  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2049  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0464745  hitchhiker  0.000360099 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5205  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 		 294 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00959428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 		 282 aa  142  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0891264  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2078  short chain dehydrogenase  35.16 
 
 		 268 aa  142  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237078  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0105  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2391  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00010416  unclonable  0.0000108368 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.499574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45705  predicted protein  35.85 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2071  short chain dehydrogenase  36.08 
 
 		 273 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00111484  unclonable  0.00000000000219735 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0934  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.08 
 
 		 247 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00491532  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1929  short chain dehydrogenase  35.16 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000156385  unclonable  0.0000000000437203 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2397  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 		 275 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1148  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.46 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2773  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.46 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 306 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2928  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.46 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458345  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2075  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 		 273 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000264648  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2274  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 		 273 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000319086  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1959  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 		 271 aa  139  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  hitchhiker  0.00037769 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1394  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 		 306 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560353  normal  0.490108 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57591  predicted protein  33.98 
 
 		 288 aa  137  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5227  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34 
 
 		 248 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  35.94 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2037  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0153445  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2267  putative short-chain dehydrogenase  35.25 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0291  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  32.7 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26730  putative short-chain dehydrogenase  34.87 
 
 		 292 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 		 252 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2411  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.2 
 
 		 255 aa  135  9e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.1 
 
 		 247 aa  135  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>