More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0229 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 259 aa  521  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 		 268 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233073 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.430043  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.85 
 
 		 264 aa  215  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0146  short chain dehydrogenase  47.04 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.43 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1758  short chain dehydrogenase  44.08 
 
 		 270 aa  198  6e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.259984  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3281  short chain dehydrogenase  43.97 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1566  short chain dehydrogenase  41.8 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1031  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 		 263 aa  193  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0687458 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0939  short chain dehydrogenase  41.04 
 
 		 254 aa  191  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1203  short chain dehydrogenase  44.13 
 
 		 271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3071  short chain dehydrogenase  45.2 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2118  short chain dehydrogenase  43.27 
 
 		 280 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000143066  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1959  short chain dehydrogenase  41.06 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  hitchhiker  0.00037769 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 		 275 aa  185  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1982  short chain dehydrogenase  42.28 
 
 		 275 aa  185  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000445056  unclonable  0.000000000077368 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 		 293 aa  183  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4095  short chain dehydrogenase  39.04 
 
 		 256 aa  183  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1145  short chain dehydrogenase  39.04 
 
 		 256 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3900  short chain dehydrogenase  39.44 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4204  short chain dehydrogenase  39.44 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982997  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3732  short chain dehydrogenase  39.44 
 
 		 254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3748  short chain dehydrogenase  39.44 
 
 		 256 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 		 294 aa  181  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2075  short chain dehydrogenase  41.06 
 
 		 273 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000264648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4007  short chain dehydrogenase  39.44 
 
 		 256 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2274  short chain dehydrogenase  41.06 
 
 		 273 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000319086  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2391  short chain dehydrogenase  41.06 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00010416  unclonable  0.0000108368 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1818  short chain dehydrogenase  40.48 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4112  short chain dehydrogenase  39.04 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4040  short chain dehydrogenase  38.65 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2071  short chain dehydrogenase  40.65 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00111484  unclonable  0.00000000000219735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2377  short chain dehydrogenase  40.65 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2037  short chain dehydrogenase  40.65 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0153445  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2078  short chain dehydrogenase  40.94 
 
 		 268 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3819  short chain dehydrogenase  39.44 
 
 		 264 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1929  short chain dehydrogenase  41.46 
 
 		 265 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000156385  unclonable  0.0000000000437203 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2049  short chain dehydrogenase  41.06 
 
 		 275 aa  178  7e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0464745  hitchhiker  0.000360099 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2692  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445957  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2397  short chain dehydrogenase  41.46 
 
 		 275 aa  176  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1336  short chain dehydrogenase  42.02 
 
 		 263 aa  175  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341301  normal  0.0949084 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07120  2, 4-dienoyl-CoA reductase (NADPH) precursor related protein  36.54 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2628  2, 4-dienoyl-CoA reductase (NADPH)-related protein  37.93 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.346863  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03790  2,4-dienoyl-CoA reductase, putative  40.87 
 
 		 289 aa  169  4e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.128522  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 		 284 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.374881  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0877  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 		 303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11319  peroxisomal 2,4-dienoyl-CoA reductase  44.15 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.184472  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1741  short chain dehydrogenase  39.27 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00532384  hitchhiker  0.00268823 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57591  predicted protein  38.65 
 
 		 288 aa  165  5.9999999999999996e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 		 252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 		 296 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0403  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19413  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 		 258 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  36.95 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 		 282 aa  155  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0891264  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1839  glucose 1-dehydrogenase  33.86 
 
 		 263 aa  155  9e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0372378  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43434  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37372  predicted protein  38.19 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11020  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.8 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 286 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.961731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 294 aa  151  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 261 aa  149  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07770  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G07470)  35.66 
 
 		 315 aa  149  5e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0479246 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1904  gluconate 5-dehydrogenase  37.55 
 
 		 270 aa  148  7e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000312184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2534  gluconate 5-dehydrogenase  39.6 
 
 		 262 aa  148  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 		 256 aa  148  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5227  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.78 
 
 		 302 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.12909  normal  0.769713 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0545  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379815  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0490  gluconate 5-dehydrogenase  36.72 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  35.46 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45705  predicted protein  36.05 
 
 		 292 aa  145  5e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 		 269 aa  145  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204031 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3412  short chain dehydrogenase  37.05 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0947163  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.913032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416119  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3946  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 		 289 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0964408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.59 
 
 		 298 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2928  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.01 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458345  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2773  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.01 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>