More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2520 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2520  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 199 aa  400  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0216463  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3613  short chain dehydrogenase  64.14 
 
 		 199 aa  263  8.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2493  short chain dehydrogenase  49.25 
 
 		 200 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1726  short chain dehydrogenase  49.25 
 
 		 200 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1778  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4306  short chain dehydrogenase  43.88 
 
 		 197 aa  168  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0657  short chain dehydrogenase  43.22 
 
 		 202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.769936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4312  short chain dehydrogenase  39.09 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1238  short chain dehydrogenase  42.35 
 
 		 199 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06295  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0313  short chain dehydrogenase  41.75 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0297  short chain dehydrogenase  41.75 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6188  short chain dehydrogenase  45.41 
 
 		 198 aa  151  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50610  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0391945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1664  short chain dehydrogenase  39.59 
 
 		 199 aa  148  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0789  short chain dehydrogenase  42.21 
 
 		 205 aa  148  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05280  short chain dehydrogenase  39.8 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5629  short chain dehydrogenase  39.09 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0927  short chain dehydrogenase  41.62 
 
 		 200 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.115438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4448  short chain dehydrogenase  38.27 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4284  short chain dehydrogenase  38.27 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.206363 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3138  short chain dehydrogenase  38.07 
 
 		 200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3793  short chain dehydrogenase  41 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0613  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0886445 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3670  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3331  short chain dehydrogenase  41.32 
 
 		 201 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3526  short chain dehydrogenase  40.36 
 
 		 233 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0150103 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2512  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296656  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2619  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 		 201 aa  124  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1873  short chain dehydrogenase  36.41 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3200  short chain dehydrogenase  36.41 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1736  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.157452 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4883  short chain dehydrogenase  34.69 
 
 		 202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl362  short chain dehydrogenase  39.63 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.68833e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5475  short chain dehydrogenase  33.16 
 
 		 202 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5387  short chain dehydrogenase  33.16 
 
 		 202 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  33.5 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.07 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  32.03 
 
 		 238 aa  72  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  32.08 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  29.94 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2546  short chain dehydrogenase  29.59 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  29.61 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2086  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 		 245 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879174  normal  0.332592 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07806  Versicolorin reductase (EC 1.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00791]  27.57 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00450533  normal  0.460888 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.8 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.37 
 
 		 247 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.93 
 
 		 245 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.94 
 
 		 246 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.47 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.47 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.47 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  29.31 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  33.94 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.57 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.91 
 
 		 249 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.743298  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.44 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0910719 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3012  putative short-chain dehydrogenase  26.18 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3856  short chain dehydrogenase  26.94 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.06 
 
 		 258 aa  53.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.315776  normal  0.0684452 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0847  short chain dehydrogenase/reductase family protein  27.03 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.25 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 		 270 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 		 250 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 		 240 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.4 
 
 		 258 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.89 
 
 		 237 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 		 240 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1104  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.18 
 
 		 247 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12325  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0256  short chain dehydrogenase  26.18 
 
 		 247 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0103  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.18 
 
 		 247 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1775  dehydrogenases with different specificities  26.18 
 
 		 247 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0321  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.18 
 
 		 247 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.15 
 
 		 266 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1687  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.18 
 
 		 247 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1272  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.18 
 
 		 247 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  32.71 
 
 		 237 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  32.71 
 
 		 237 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  32.71 
 
 		 237 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1223  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  24.39 
 
 		 254 aa  51.6  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3870  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 		 259 aa  51.6  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 		 240 aa  51.6  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  29.91 
 
 		 237 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 		 285 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  23.44 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0443  glucose 1-dehydrogenase  27.15 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.14 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>