More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3437 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 237 aa  445  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00973208  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.16 
 
 		 242 aa  275  6e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0860852  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.92 
 
 		 242 aa  271  7e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.61 
 
 		 245 aa  235  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344102 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.03 
 
 		 244 aa  205  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195415  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1318  glucose-1-dehydrogenase  46.15 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573048  normal  0.212962 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3241  glucose-1-dehydrogenase  46.15 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2504  glucose-1-dehydrogenase  47.37 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0324854 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000874  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  42.98 
 
 		 243 aa  187  9e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2376  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 		 248 aa  184  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.985794 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3141  short chain dehydrogenase  46.15 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167044  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0371739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.06 
 
 		 247 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2526  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3547  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.13 
 
 		 248 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.765075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.64 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.46 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1035  glucose-1-dehydrogenase  48.76 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.56 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2227  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.858408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2298  glucose-1-dehydrogenase  48.76 
 
 		 253 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2032  glucose-1-dehydrogenase  45.75 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.569693  normal  0.784384 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2368  glucose-1-dehydrogenase  46.15 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.445485  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.62 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0871917  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.53 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.580093  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2158  glucose 1-dehydrogenase  41.56 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2758  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  41.3 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0263508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1663  glucose-1-dehydrogenase  47.95 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523612  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06849  hypothetical protein  40.5 
 
 		 243 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2275  glucose-1-dehydrogenase  47.95 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2772  glucose-1-dehydrogenase  45.34 
 
 		 248 aa  175  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1482  glucose 1-dehydrogenase  42.8 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.350696  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2487  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147298  normal  0.672807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0396102  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0012  putative short-chain dehydrogenase  43.32 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.891592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185736  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3321  hypothetical protein  41.39 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2004  short chain dehydrogenase  42.51 
 
 		 248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.108608  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 		 248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2688  putative short-chain dehydrogenase/reductase  43.32 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00737527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5602  glucose-1-dehydrogenase  47.52 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1270  glucose-1-dehydrogenase  49.75 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151441  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1263  glucose-1-dehydrogenase  49.75 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.859357  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 		 248 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.124334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0763  glucose-1-dehydrogenase  49.75 
 
 		 252 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0386  glucose-1-dehydrogenase  49.75 
 
 		 252 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1859  glucose-1-dehydrogenase  49.75 
 
 		 252 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1103  glucose-1-dehydrogenase  49.75 
 
 		 252 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2191  glucose-1-dehydrogenase  47.11 
 
 		 253 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2313  glucose-1-dehydrogenase  47.11 
 
 		 253 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0397  oxidoreductase  41.49 
 
 		 248 aa  170  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1003  glucose-1-dehydrogenase  47.93 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 		 248 aa  170  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0908582 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3909  hypothetical protein  40.89 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1408  glucose-1-dehydrogenase  49.25 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23650  short chain dehydrogenase  42.51 
 
 		 248 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0188614 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00539118  normal  0.224466 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.6 
 
 		 268 aa  169  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00171075 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 		 250 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1409  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3521  oxidoreductase  41.74 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1253  glucose-1-dehydrogenase  46.28 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0185509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.994157  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 247 aa  161  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0807  hypothetical protein  40.24 
 
 		 247 aa  161  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.540927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4885  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.36 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0254  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.818245  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139142  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759419 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0095  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 		 249 aa  159  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02734  predicted NAD(P)-binding oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  39.84 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02697  hypothetical protein  39.84 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3061  hypothetical protein  39.84 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3229  hypothetical protein  39.84 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 		 247 aa  158  8e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.88009  normal  0.487287 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3323  hypothetical protein  39.43 
 
 		 247 aa  155  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3527  oxidoreductase  40.56 
 
 		 250 aa  148  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.04 
 
 		 246 aa  148  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.33 
 
 		 247 aa  148  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1476  oxidoreductase  42.48 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.68 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1860  oxidoreductase  42.04 
 
 		 237 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.33 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5771  oxidoreductase  41.33 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1657  oxidoreductase  42.04 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4821  oxidoreductase  41.33 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3763  oxidoreductase  41.33 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04116  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  41.33 
 
 		 237 aa  142  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1798  oxidoreductase  42.04 
 
 		 237 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0401257  normal  0.0380539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>