More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3321 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3321  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  525  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.16 
 
 
247 aa  410  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0807  hypothetical protein  80.16 
 
 
247 aa  410  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.540927  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02734  predicted NAD(P)-binding oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  80.16 
 
 
247 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02697  hypothetical protein  80.16 
 
 
247 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3229  hypothetical protein  80.16 
 
 
247 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3061  hypothetical protein  80.16 
 
 
247 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3323  hypothetical protein  79.76 
 
 
247 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3909  hypothetical protein  75.81 
 
 
248 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.35 
 
 
248 aa  345  5e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1482  glucose 1-dehydrogenase  61.89 
 
 
250 aa  320  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.350696  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1409  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.86 
 
 
249 aa  317  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2158  glucose 1-dehydrogenase  59.43 
 
 
250 aa  308  5e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.22 
 
 
248 aa  300  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2004  short chain dehydrogenase  59.59 
 
 
248 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.108608  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.32 
 
 
247 aa  297  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.994157  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.96 
 
 
248 aa  293  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23650  short chain dehydrogenase  58.37 
 
 
248 aa  291  9e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0188614 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06849  hypothetical protein  59.43 
 
 
243 aa  288  8e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000874  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  59.18 
 
 
243 aa  286  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0095  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 
249 aa  285  8e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3141  short chain dehydrogenase  58.78 
 
 
248 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 
248 aa  281  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.124334  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2376  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.88 
 
 
248 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.985794 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.29 
 
 
248 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0371739 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.14 
 
 
253 aa  277  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2526  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.88 
 
 
248 aa  275  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.73 
 
 
249 aa  275  4e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3547  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  53.47 
 
 
248 aa  274  8e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.765075  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.29 
 
 
248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0908582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.55 
 
 
251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2227  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.47 
 
 
248 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.858408  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0397  oxidoreductase  53.88 
 
 
248 aa  271  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0012  putative short-chain dehydrogenase  55.14 
 
 
253 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.891592 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2688  putative short-chain dehydrogenase/reductase  53.91 
 
 
253 aa  270  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00737527  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3527  oxidoreductase  55.1 
 
 
250 aa  266  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.69 
 
 
248 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759419 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0254  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.1 
 
 
248 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.818245  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.29 
 
 
250 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.69 
 
 
248 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.29 
 
 
248 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00539118  normal  0.224466 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.65 
 
 
248 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2758  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  51.43 
 
 
248 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0263508  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.63 
 
 
246 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185736  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1318  glucose-1-dehydrogenase  51.85 
 
 
248 aa  258  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573048  normal  0.212962 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.47 
 
 
247 aa  258  9e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139142  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1663  glucose-1-dehydrogenase  51.84 
 
 
253 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2275  glucose-1-dehydrogenase  51.84 
 
 
253 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3241  glucose-1-dehydrogenase  51.85 
 
 
248 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.69 
 
 
248 aa  255  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3521  oxidoreductase  49.79 
 
 
253 aa  254  9e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4885  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.55 
 
 
245 aa  252  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2298  glucose-1-dehydrogenase  51.44 
 
 
253 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2191  glucose-1-dehydrogenase  51.03 
 
 
253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1035  glucose-1-dehydrogenase  52.26 
 
 
261 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2487  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
248 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147298  normal  0.672807 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5602  glucose-1-dehydrogenase  51.03 
 
 
253 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2313  glucose-1-dehydrogenase  51.03 
 
 
253 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2504  glucose-1-dehydrogenase  50.62 
 
 
248 aa  250  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0324854 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2032  glucose-1-dehydrogenase  51.61 
 
 
248 aa  249  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.569693  normal  0.784384 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1003  glucose-1-dehydrogenase  51.03 
 
 
253 aa  249  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.65 
 
 
250 aa  242  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0185509  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.26 
 
 
247 aa  239  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.06 
 
 
250 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75761  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.43 
 
 
268 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00171075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2772  glucose-1-dehydrogenase  52.67 
 
 
248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2368  glucose-1-dehydrogenase  52.67 
 
 
248 aa  232  5e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.445485  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1263  glucose-1-dehydrogenase  50.61 
 
 
252 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.859357  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1408  glucose-1-dehydrogenase  50.61 
 
 
271 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.41 
 
 
242 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1270  glucose-1-dehydrogenase  50.61 
 
 
252 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.59 
 
 
265 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0396102  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0386  glucose-1-dehydrogenase  50.61 
 
 
252 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1859  glucose-1-dehydrogenase  50.61 
 
 
252 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1103  glucose-1-dehydrogenase  50.61 
 
 
252 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0763  glucose-1-dehydrogenase  50.61 
 
 
252 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.79 
 
 
247 aa  229  4e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.88009  normal  0.487287 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.67 
 
 
244 aa  229  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195415  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1253  glucose-1-dehydrogenase  51.85 
 
 
247 aa  227  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.19 
 
 
252 aa  216  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.580093  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.33 
 
 
245 aa  203  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.26 
 
 
242 aa  202  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699657 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.12 
 
 
250 aa  198  7.999999999999999e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
251 aa  193  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0871917  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 
242 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0860852  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
245 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344102 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
252 aa  169  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.16 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4547  glucose-1-dehydrogenase  39.68 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 
246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.34 
 
 
250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  38.34 
 
 
250 aa  161  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  38.46 
 
 
261 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4828  glucose-1-dehydrogenase  39.18 
 
 
261 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3100  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 
247 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.012371 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4612  glucose-1-dehydrogenase  39.18 
 
 
261 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  38.89 
 
 
261 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4968  glucose-1-dehydrogenase  39.18 
 
 
261 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
252 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.22334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>