More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5891 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 253 aa  507  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2688  putative short-chain dehydrogenase/reductase  91.3 
 
 		 253 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00737527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0012  putative short-chain dehydrogenase  89.33 
 
 		 253 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.891592 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2004  short chain dehydrogenase  60 
 
 		 248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.108608  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23650  short chain dehydrogenase  59.18 
 
 		 248 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0188614 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3909  hypothetical protein  57.61 
 
 		 248 aa  294  7e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2158  glucose 1-dehydrogenase  54.55 
 
 		 250 aa  288  6e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2227  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.1 
 
 		 248 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.858408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.15 
 
 		 247 aa  285  5.999999999999999e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.994157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3321  hypothetical protein  55.14 
 
 		 258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.33 
 
 		 248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2526  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.69 
 
 		 248 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2758  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  53.06 
 
 		 248 aa  281  9e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0263508  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3547  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  53.88 
 
 		 248 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.765075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0095  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.63 
 
 		 249 aa  279  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2376  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.06 
 
 		 248 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.985794 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.73 
 
 		 247 aa  278  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0807  hypothetical protein  54.73 
 
 		 247 aa  278  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.540927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.1 
 
 		 248 aa  278  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.124334  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2487  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.47 
 
 		 248 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147298  normal  0.672807 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1482  glucose 1-dehydrogenase  52.61 
 
 		 250 aa  277  9e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.350696  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1409  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.47 
 
 		 249 aa  276  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02734  predicted NAD(P)-binding oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  54.32 
 
 		 247 aa  275  4e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3229  hypothetical protein  54.32 
 
 		 247 aa  275  4e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02697  hypothetical protein  54.32 
 
 		 247 aa  275  4e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3061  hypothetical protein  54.32 
 
 		 247 aa  275  4e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.65 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0371739 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3323  hypothetical protein  53.91 
 
 		 247 aa  272  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.04 
 
 		 248 aa  271  8.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.1 
 
 		 246 aa  267  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185736  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1318  glucose-1-dehydrogenase  53.28 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573048  normal  0.212962 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3141  short chain dehydrogenase  54.69 
 
 		 248 aa  261  8e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167044  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 		 250 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3241  glucose-1-dehydrogenase  52.05 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.44 
 
 		 248 aa  257  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.24 
 
 		 248 aa  255  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0908582 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3527  oxidoreductase  52.42 
 
 		 250 aa  255  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0397  oxidoreductase  51.03 
 
 		 248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.98 
 
 		 249 aa  253  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1003  glucose-1-dehydrogenase  51.78 
 
 		 253 aa  252  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1035  glucose-1-dehydrogenase  52.87 
 
 		 261 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0254  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 		 248 aa  248  7e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.818245  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2191  glucose-1-dehydrogenase  49.8 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.02 
 
 		 248 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00539118  normal  0.224466 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2313  glucose-1-dehydrogenase  49.41 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 		 248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759419 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2298  glucose-1-dehydrogenase  49.41 
 
 		 253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.61 
 
 		 248 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.4 
 
 		 250 aa  244  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0185509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1663  glucose-1-dehydrogenase  49.01 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2275  glucose-1-dehydrogenase  49.01 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5602  glucose-1-dehydrogenase  49.01 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000874  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  48.57 
 
 		 243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2032  glucose-1-dehydrogenase  51.43 
 
 		 248 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.569693  normal  0.784384 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.02 
 
 		 248 aa  242  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06849  hypothetical protein  47.54 
 
 		 243 aa  242  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3521  oxidoreductase  49.18 
 
 		 253 aa  240  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1270  glucose-1-dehydrogenase  51.81 
 
 		 252 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151441  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1263  glucose-1-dehydrogenase  51.81 
 
 		 252 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.859357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 		 247 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139142  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.97 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1859  glucose-1-dehydrogenase  52.24 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1408  glucose-1-dehydrogenase  51.81 
 
 		 271 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0386  glucose-1-dehydrogenase  52.24 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1103  glucose-1-dehydrogenase  52.24 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0763  glucose-1-dehydrogenase  52.24 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4885  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.47 
 
 		 245 aa  234  9e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2504  glucose-1-dehydrogenase  50 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0324854 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.41 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00171075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.81 
 
 		 265 aa  231  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0396102  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 		 248 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.41 
 
 		 244 aa  224  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195415  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1253  glucose-1-dehydrogenase  51.64 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.18 
 
 		 247 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.88009  normal  0.487287 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.76 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699657 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2772  glucose-1-dehydrogenase  48.77 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2368  glucose-1-dehydrogenase  48.77 
 
 		 248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.445485  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.13 
 
 		 247 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 242 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.94 
 
 		 242 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0860852  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.12 
 
 		 250 aa  195  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.580093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.83 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344102 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0871917  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 		 251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 288 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0346785  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 		 295 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.546475  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 		 246 aa  158  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.33 
 
 		 237 aa  158  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00973208  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 306 aa  158  9e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306467  normal  0.765133 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.8 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22650  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  38.11 
 
 		 306 aa  155  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17140  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  39.34 
 
 		 307 aa  155  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 		 295 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>