More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3776 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 245 aa  483  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.61 
 
 		 248 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3909  hypothetical protein  50.2 
 
 		 248 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.15 
 
 		 247 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0807  hypothetical protein  48.15 
 
 		 247 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.540927  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02734  predicted NAD(P)-binding oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  48.15 
 
 		 247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02697  hypothetical protein  48.15 
 
 		 247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3061  hypothetical protein  48.15 
 
 		 247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3229  hypothetical protein  48.15 
 
 		 247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.46 
 
 		 248 aa  214  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.69 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0397  oxidoreductase  48.59 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3323  hypothetical protein  47.74 
 
 		 247 aa  211  7e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 		 248 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00539118  normal  0.224466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.4 
 
 		 248 aa  209  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0908582 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.4 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3141  short chain dehydrogenase  51.01 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.98 
 
 		 248 aa  208  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.8 
 
 		 250 aa  207  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3321  hypothetical protein  47.33 
 
 		 258 aa  207  9e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1409  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23650  short chain dehydrogenase  48.58 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0188614 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.96 
 
 		 248 aa  205  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.57 
 
 		 248 aa  204  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.124334  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0254  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.21 
 
 		 248 aa  204  9e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.818245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.4 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2004  short chain dehydrogenase  47.77 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.108608  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2758  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  45.31 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0263508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.72 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.994157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 		 253 aa  198  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2158  glucose 1-dehydrogenase  43.95 
 
 		 250 aa  198  7.999999999999999e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2688  putative short-chain dehydrogenase/reductase  44.49 
 
 		 253 aa  197  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00737527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1482  glucose 1-dehydrogenase  45.16 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.350696  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2487  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.12 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147298  normal  0.672807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2526  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 		 248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.41 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139142  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2376  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 		 248 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.985794 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.31 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0371739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3547  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.94 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.765075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2227  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 		 248 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.858408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.6 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0185509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.4 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0012  putative short-chain dehydrogenase  43.27 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.891592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.2 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3521  oxidoreductase  43.9 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1318  glucose-1-dehydrogenase  45.68 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573048  normal  0.212962 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0095  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.75 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.580093  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00171075 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.91 
 
 		 247 aa  182  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4885  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 		 245 aa  182  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3527  oxidoreductase  44.58 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2504  glucose-1-dehydrogenase  45.08 
 
 		 248 aa  181  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0324854 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.27 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185736  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1003  glucose-1-dehydrogenase  46.18 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1035  glucose-1-dehydrogenase  47.33 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3241  glucose-1-dehydrogenase  45.27 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000874  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  43.67 
 
 		 243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1663  glucose-1-dehydrogenase  45.78 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2275  glucose-1-dehydrogenase  45.78 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2191  glucose-1-dehydrogenase  44.8 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2298  glucose-1-dehydrogenase  45.38 
 
 		 253 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2313  glucose-1-dehydrogenase  44.4 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5602  glucose-1-dehydrogenase  44.58 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.22 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0396102  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 		 244 aa  175  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195415  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1408  glucose-1-dehydrogenase  47.39 
 
 		 271 aa  174  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1270  glucose-1-dehydrogenase  47.39 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151441  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06849  hypothetical protein  42.04 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1263  glucose-1-dehydrogenase  47.39 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.859357  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1859  glucose-1-dehydrogenase  47.39 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0386  glucose-1-dehydrogenase  47.39 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0763  glucose-1-dehydrogenase  47.39 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1103  glucose-1-dehydrogenase  47.39 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1253  glucose-1-dehydrogenase  47.13 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2772  glucose-1-dehydrogenase  45.08 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2032  glucose-1-dehydrogenase  41.63 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.569693  normal  0.784384 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2368  glucose-1-dehydrogenase  45.08 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.445485  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.56 
 
 		 242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 		 242 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0860852  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.72 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.88009  normal  0.487287 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.26 
 
 		 251 aa  155  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0871917  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 		 246 aa  151  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2429  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.83 
 
 		 247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047151  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.68 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.42 
 
 		 250 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.42 
 
 		 250 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  38.14 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 247 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29820  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  39.91 
 
 		 248 aa  139  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 		 247 aa  138  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.41 
 
 		 244 aa  138  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.58 
 
 		 246 aa  138  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>