More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1129 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 247 aa  485  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139142  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  87.45 
 
 		 248 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0908582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.58 
 
 		 251 aa  341  8e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.34 
 
 		 248 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.124334  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0397  oxidoreductase  64.63 
 
 		 248 aa  322  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.18 
 
 		 248 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.85 
 
 		 248 aa  314  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00539118  normal  0.224466 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.63 
 
 		 248 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.9 
 
 		 248 aa  308  5e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23650  short chain dehydrogenase  62.9 
 
 		 248 aa  308  8e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0188614 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.16 
 
 		 250 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2004  short chain dehydrogenase  62.1 
 
 		 248 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.108608  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0254  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.31 
 
 		 248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.818245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.5 
 
 		 248 aa  300  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.67 
 
 		 248 aa  298  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.87 
 
 		 248 aa  294  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3909  hypothetical protein  57.66 
 
 		 248 aa  292  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.16 
 
 		 249 aa  289  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3527  oxidoreductase  59.6 
 
 		 250 aa  287  8e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2504  glucose-1-dehydrogenase  59.68 
 
 		 248 aa  287  9e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0324854 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3141  short chain dehydrogenase  60.48 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167044  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2227  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.45 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.858408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2376  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.05 
 
 		 248 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.985794 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3547  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  56.45 
 
 		 248 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.765075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.63 
 
 		 250 aa  281  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0185509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2526  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.65 
 
 		 248 aa  280  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.86 
 
 		 250 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.24 
 
 		 248 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0371739 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1318  glucose-1-dehydrogenase  56.05 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573048  normal  0.212962 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.88 
 
 		 247 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.4 
 
 		 265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0396102  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0807  hypothetical protein  53.88 
 
 		 247 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.540927  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02734  predicted NAD(P)-binding oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  54.29 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3061  hypothetical protein  54.29 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3229  hypothetical protein  54.29 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02697  hypothetical protein  54.29 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3241  glucose-1-dehydrogenase  56.45 
 
 		 248 aa  272  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.8 
 
 		 268 aa  272  5.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00171075 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1482  glucose 1-dehydrogenase  53.88 
 
 		 250 aa  271  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.350696  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.63 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3323  hypothetical protein  53.88 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.66 
 
 		 247 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.994157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3321  hypothetical protein  53.47 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2487  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.03 
 
 		 248 aa  265  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147298  normal  0.672807 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.3 
 
 		 247 aa  265  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2758  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  53.23 
 
 		 248 aa  265  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0263508  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1409  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.81 
 
 		 249 aa  264  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.35 
 
 		 247 aa  262  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.88009  normal  0.487287 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4885  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.82 
 
 		 245 aa  262  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1003  glucose-1-dehydrogenase  56.91 
 
 		 253 aa  262  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1663  glucose-1-dehydrogenase  55.69 
 
 		 253 aa  261  8e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2275  glucose-1-dehydrogenase  55.69 
 
 		 253 aa  261  8e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2298  glucose-1-dehydrogenase  55.28 
 
 		 253 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2368  glucose-1-dehydrogenase  58.06 
 
 		 248 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.445485  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2191  glucose-1-dehydrogenase  55.69 
 
 		 253 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.85 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185736  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2313  glucose-1-dehydrogenase  55.69 
 
 		 253 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5602  glucose-1-dehydrogenase  54.88 
 
 		 253 aa  258  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2772  glucose-1-dehydrogenase  57.66 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3521  oxidoreductase  52.63 
 
 		 253 aa  257  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000874  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  52.02 
 
 		 243 aa  254  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2158  glucose 1-dehydrogenase  49.39 
 
 		 250 aa  254  6e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2032  glucose-1-dehydrogenase  54.44 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.569693  normal  0.784384 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1035  glucose-1-dehydrogenase  54.07 
 
 		 261 aa  249  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2688  putative short-chain dehydrogenase/reductase  51.02 
 
 		 253 aa  244  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00737527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0095  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 		 249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06849  hypothetical protein  48.99 
 
 		 243 aa  241  6e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.87 
 
 		 244 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195415  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0012  putative short-chain dehydrogenase  51.02 
 
 		 253 aa  239  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.891592 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1253  glucose-1-dehydrogenase  54.51 
 
 		 247 aa  237  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1263  glucose-1-dehydrogenase  55.28 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.859357  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1408  glucose-1-dehydrogenase  55.28 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1270  glucose-1-dehydrogenase  55.28 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151441  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1103  glucose-1-dehydrogenase  55.28 
 
 		 252 aa  235  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1859  glucose-1-dehydrogenase  55.28 
 
 		 252 aa  235  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0386  glucose-1-dehydrogenase  55.28 
 
 		 252 aa  235  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0763  glucose-1-dehydrogenase  55.28 
 
 		 252 aa  235  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.63 
 
 		 242 aa  231  9e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.03 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.59 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.19 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0860852  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.41 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.35 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.580093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.89 
 
 		 245 aa  174  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344102 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 		 251 aa  166  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0871917  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 		 295 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0346785  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 		 249 aa  158  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  38.62 
 
 		 261 aa  158  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.546475  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 		 295 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 293 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.133433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0408  glucose-1-dehydrogenase  39.43 
 
 		 261 aa  154  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1961  putative glucose 1-dehydrogenase  41.53 
 
 		 254 aa  154  9e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.536357  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2039  glucose 1-dehydrogenase, putative  41.13 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0380824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  39.02 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4828  glucose-1-dehydrogenase  39.02 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.59 
 
 		 247 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0368  glucose-1-dehydrogenase  41.06 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0342914  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>