More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0697 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
263 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0924  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  50.4 
 
 
260 aa  245  4e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.171605  normal  0.571441 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 
259 aa  235  7e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.191846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
259 aa  229  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.965402  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.9 
 
 
257 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.97 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735777  normal  0.247355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.9 
 
 
256 aa  195  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0881608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
261 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 
256 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
269 aa  181  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
287 aa  180  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 
265 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
272 aa  176  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178031  hitchhiker  0.00135629 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
255 aa  176  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  38.82 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  42.56 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.56 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
258 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1661  glucose 1-dehydrogenase  35.57 
 
 
268 aa  171  7.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218295  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
269 aa  169  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  36.65 
 
 
269 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 
285 aa  169  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  37.4 
 
 
261 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.32 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0906  acetoin dehydrogenase  39.68 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.957283  normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
261 aa  166  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  40.5 
 
 
261 aa  166  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3264  acetoin dehydrogenase  38.98 
 
 
253 aa  165  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0298905 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02067  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  38.58 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02025  hypothetical protein  38.58 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
257 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0834  acetoin dehydrogenase  38.58 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2272  acetoin dehydrogenase  38.58 
 
 
253 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1510  acetoin dehydrogenase  38.58 
 
 
253 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2427  acetoin dehydrogenase  38.58 
 
 
253 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.4 
 
 
250 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.4 
 
 
250 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4852  glucose-1-dehydrogenase  36.18 
 
 
261 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2517  acetoin dehydrogenase  38.52 
 
 
260 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2405  acetoin dehydrogenase  38.52 
 
 
260 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2316  acetoin dehydrogenase  38.52 
 
 
260 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
257 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2360  acetoin dehydrogenase  38.98 
 
 
253 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4448  glucose-1-dehydrogenase  36.18 
 
 
261 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
246 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4858  glucose-1-dehydrogenase  35.77 
 
 
261 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2409  acetoin dehydrogenase  38.13 
 
 
260 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.76 
 
 
247 aa  159  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0867  acetoin dehydrogenase  41.73 
 
 
279 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3909  hypothetical protein  39.59 
 
 
248 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3123  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.96 
 
 
251 aa  159  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0932491  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
268 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.657401  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.11 
 
 
247 aa  159  5e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4547  glucose-1-dehydrogenase  35.77 
 
 
261 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.4 
 
 
248 aa  158  9e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  35.37 
 
 
261 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4834  glucose-1-dehydrogenase  35.77 
 
 
261 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2737  acetoin dehydrogenase  38.34 
 
 
257 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0408  glucose-1-dehydrogenase  35.37 
 
 
261 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0368  glucose-1-dehydrogenase  36.99 
 
 
261 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0342914  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2972  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
245 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4828  glucose-1-dehydrogenase  35.37 
 
 
261 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0948  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.83 
 
 
249 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000118605  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
261 aa  157  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.499955 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.51 
 
 
250 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2783  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.75 
 
 
245 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335841  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4612  glucose-1-dehydrogenase  35.37 
 
 
261 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548081  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
277 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.837634  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4968  glucose-1-dehydrogenase  35.37 
 
 
261 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
271 aa  155  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40299  normal  0.0331692 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0443  glucose 1-dehydrogenase  38.74 
 
 
266 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4160  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
247 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0453  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.99 
 
 
249 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.465318  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1381  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.96 
 
 
248 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.049098  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3947  acetoin dehydrogenase  40.89 
 
 
272 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.203459 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.3 
 
 
244 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05161  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  36.99 
 
 
249 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.426884  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13073  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein  39.29 
 
 
253 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
268 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05091  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  37.4 
 
 
249 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1840  glucose 1-dehydrogenase  40.55 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.714483  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2084  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.06 
 
 
250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558768  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
276 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.43 
 
 
247 aa  152  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04781  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  37.4 
 
 
249 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 
248 aa  152  8e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
247 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0807  hypothetical protein  37.55 
 
 
247 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.540927  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 
247 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3207  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.25 
 
 
246 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.819769  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  41.49 
 
 
255 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0943  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.59 
 
 
246 aa  150  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000752112  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.29 
 
 
251 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  38.21 
 
 
250 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3229  hypothetical protein  37.55 
 
 
247 aa  149  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3061  hypothetical protein  37.55 
 
 
247 aa  149  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>