More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3000 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
295 aa  597  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.546475  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  98.64 
 
 
295 aa  591  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0346785  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  95.93 
 
 
295 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.31 
 
 
293 aa  482  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.133433  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1317  Short-chain dehydrogenase  60.78 
 
 
288 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169913  normal  0.0434292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.64 
 
 
285 aa  341  7e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.359984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.14 
 
 
286 aa  340  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.64 
 
 
288 aa  340  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.86 
 
 
285 aa  340  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.21 
 
 
285 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.58 
 
 
300 aa  337  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.04 
 
 
285 aa  333  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.07 
 
 
286 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.86 
 
 
288 aa  330  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306467  normal  0.765133 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.23 
 
 
298 aa  330  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.795136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2695  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.07 
 
 
285 aa  329  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.28 
 
 
286 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453828  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.79 
 
 
286 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5588  dehydrogenase  56.99 
 
 
285 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.76 
 
 
285 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.798039  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2411  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.93 
 
 
286 aa  326  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.12 
 
 
288 aa  325  4.0000000000000003e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.2 
 
 
285 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0775551 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.43 
 
 
285 aa  325  7e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2677  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  54.29 
 
 
286 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.8 
 
 
288 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207761 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  53.41 
 
 
285 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.612253  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.07 
 
 
285 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.319892  normal  0.963036 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.41 
 
 
285 aa  318  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539155  normal  0.142405 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.23 
 
 
286 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.41 
 
 
285 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0919  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.71 
 
 
285 aa  318  9e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.83 
 
 
298 aa  317  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.2 
 
 
286 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.29 
 
 
285 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000245222 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.29 
 
 
285 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.402229  normal  0.230445 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.63 
 
 
292 aa  311  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0684702 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.43 
 
 
285 aa  310  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.29 
 
 
285 aa  310  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.05 
 
 
285 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4376  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.04 
 
 
285 aa  308  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.11 
 
 
284 aa  308  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.11 
 
 
287 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.02 
 
 
292 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.082877 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1180  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.36 
 
 
293 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1134  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.86 
 
 
285 aa  306  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2292  short-chain dehydrogenase/reductase, oxidoreductase  51.84 
 
 
291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.253121  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.75 
 
 
285 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0632  short chain dehydrogenase  50.55 
 
 
288 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000680928  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.55 
 
 
287 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3986  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.22 
 
 
297 aa  301  9e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.11 
 
 
288 aa  300  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19840  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  55.6 
 
 
297 aa  297  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  51.09 
 
 
286 aa  297  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.66 
 
 
311 aa  296  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52 
 
 
286 aa  296  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.984934 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0818  short chain dehydrogenase  50.74 
 
 
288 aa  295  5e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.47 
 
 
308 aa  295  8e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278854  normal  0.143787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.27 
 
 
286 aa  295  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0655  short chain dehydrogenase  50.37 
 
 
288 aa  294  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000332724  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.81 
 
 
306 aa  293  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4525  short chain dehydrogenase  50.37 
 
 
288 aa  293  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.193288 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.8 
 
 
297 aa  293  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36870  putative short-chain dehydrogenase  52.01 
 
 
286 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0912  short chain dehydrogenase  50 
 
 
288 aa  292  4e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0712  short chain dehydrogenase  49.63 
 
 
288 aa  292  6e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0663  short chain dehydrogenase  49.63 
 
 
288 aa  292  6e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0824  short chain dehydrogenase  49.63 
 
 
288 aa  292  6e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.87827e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0748  short chain dehydrogenase  49.63 
 
 
288 aa  292  6e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0667  short chain dehydrogenase  50 
 
 
288 aa  291  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.73 
 
 
280 aa  291  9e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1292  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
339 aa  290  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.71 
 
 
297 aa  290  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.01 
 
 
284 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.847413  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22650  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  53.79 
 
 
306 aa  289  3e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0805  short chain dehydrogenase  50 
 
 
288 aa  289  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3506  oxidoreductase  53.05 
 
 
294 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3331  oxidoreductase  53.05 
 
 
294 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3411  oxidoreductase  53.05 
 
 
294 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.73 
 
 
283 aa  288  7e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.623157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3405  oxidoreductase  53.05 
 
 
294 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.441834 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.69 
 
 
294 aa  288  8e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3472  oxidoreductase  52.69 
 
 
294 aa  288  9e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.01 
 
 
286 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.317832 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.01 
 
 
286 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3289  oxidoreductase  53.05 
 
 
294 aa  288  9e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3432  oxidoreductase  52.69 
 
 
294 aa  288  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4315  oxidoreductase  52.69 
 
 
294 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02878  oxidoreductase  52.69 
 
 
294 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3340  oxidoreductase  53.05 
 
 
294 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.461331 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3182  oxidoreductase  52.69 
 
 
294 aa  288  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.26 
 
 
299 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.35 
 
 
304 aa  286  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.61 
 
 
333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752467  normal  0.0103168 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2925  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  48.18 
 
 
296 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.92 
 
 
293 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116516  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.02 
 
 
298 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0691  oxidoreductase  52.33 
 
 
294 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06640  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  52.08 
 
 
309 aa  285  5e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55 
 
 
286 aa  285  5e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.066838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>