More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2288 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
306 aa  622  1e-177  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.72 
 
 
285 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.46 
 
 
285 aa  415  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566144  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.79 
 
 
287 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.69 
 
 
285 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.26 
 
 
288 aa  402  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.17 
 
 
284 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.67 
 
 
287 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.67 
 
 
296 aa  381  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.530393 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4376  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.89 
 
 
285 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36870  putative short-chain dehydrogenase  63.35 
 
 
286 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  65.69 
 
 
286 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1180  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.23 
 
 
293 aa  375  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.44 
 
 
286 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.44 
 
 
286 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.317832 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.29 
 
 
285 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.87 
 
 
284 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361211  hitchhiker  0.00000740353 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.66 
 
 
285 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.91 
 
 
285 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0516293 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.66 
 
 
285 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.94 
 
 
282 aa  365  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.54 
 
 
285 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  normal  0.0427159 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.54 
 
 
285 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11398  normal  0.546447 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.56 
 
 
289 aa  363  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.23 
 
 
286 aa  362  4e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.984934 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.49 
 
 
297 aa  362  5.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0632  short chain dehydrogenase  62.04 
 
 
288 aa  361  8e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000680928  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.23 
 
 
286 aa  360  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.87 
 
 
288 aa  359  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.1 
 
 
283 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4525  short chain dehydrogenase  60.58 
 
 
288 aa  349  3e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.193288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0818  short chain dehydrogenase  60.22 
 
 
288 aa  349  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.82 
 
 
283 aa  348  5e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.623157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0912  short chain dehydrogenase  60.58 
 
 
288 aa  348  6e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0712  short chain dehydrogenase  60.58 
 
 
288 aa  348  9e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0663  short chain dehydrogenase  60.58 
 
 
288 aa  348  9e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0655  short chain dehydrogenase  60.22 
 
 
288 aa  348  9e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000332724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0824  short chain dehydrogenase  60.58 
 
 
288 aa  348  9e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.87827e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0748  short chain dehydrogenase  60.58 
 
 
288 aa  348  9e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.31 
 
 
284 aa  347  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.847413  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0667  short chain dehydrogenase  59.85 
 
 
288 aa  347  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.21 
 
 
282 aa  345  6e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.64 
 
 
287 aa  345  6e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259282  normal  0.969458 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0805  short chain dehydrogenase  59.85 
 
 
288 aa  343  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0991  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  62.36 
 
 
291 aa  342  4e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.123495  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.27 
 
 
287 aa  342  5.999999999999999e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1971  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  62.36 
 
 
285 aa  342  7e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0942003  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1370  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  62.36 
 
 
285 aa  342  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2253  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  62.36 
 
 
285 aa  342  7e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1278  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  62.36 
 
 
285 aa  342  7e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.93331  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3149  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  62.36 
 
 
285 aa  342  7e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.653242  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3020  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  62.36 
 
 
285 aa  342  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 
284 aa  339  4e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.22798  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2129  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  57.09 
 
 
289 aa  336  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2925  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  57.09 
 
 
296 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.95 
 
 
292 aa  335  7.999999999999999e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.907948  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.77 
 
 
300 aa  333  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55 
 
 
284 aa  330  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2292  short-chain dehydrogenase/reductase, oxidoreductase  53.82 
 
 
291 aa  326  3e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.253121  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.38 
 
 
308 aa  323  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278854  normal  0.143787 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.16 
 
 
291 aa  319  5e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.608035  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.23 
 
 
285 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.359984 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1817  short chain dehydrogenase  54.92 
 
 
337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2744  short chain dehydrogenase  56.55 
 
 
334 aa  312  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0520687 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2584  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  51.4 
 
 
292 aa  312  4.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.52 
 
 
286 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.23 
 
 
285 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2905  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  51.05 
 
 
292 aa  311  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.87 
 
 
285 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1207  short chain dehydrogenase  53.61 
 
 
337 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1317  Short-chain dehydrogenase  54.39 
 
 
288 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169913  normal  0.0434292 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.36 
 
 
298 aa  305  6e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.77 
 
 
286 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.56 
 
 
295 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0346785  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5297  short chain dehydrogenase  52.03 
 
 
317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460339 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.72 
 
 
285 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716847  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3899  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.96 
 
 
284 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.190456 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.72 
 
 
285 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.110576 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.39 
 
 
285 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0775551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.35 
 
 
285 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.86 
 
 
293 aa  301  9e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116516  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.09 
 
 
286 aa  301  9e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.19 
 
 
295 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.17 
 
 
286 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.81 
 
 
295 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.546475  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.59 
 
 
293 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.133433  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.49 
 
 
298 aa  299  4e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.795136 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.04 
 
 
288 aa  299  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207761 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.13 
 
 
288 aa  298  6e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306467  normal  0.765133 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.35 
 
 
284 aa  298  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.757824  normal  0.126466 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.65 
 
 
288 aa  297  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.68 
 
 
285 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539155  normal  0.142405 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.9 
 
 
286 aa  297  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1292  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.87 
 
 
339 aa  297  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.2 
 
 
285 aa  296  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4753  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.65 
 
 
284 aa  296  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163262  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5588  dehydrogenase  55.36 
 
 
285 aa  295  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.58 
 
 
335 aa  293  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000556089  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.19 
 
 
286 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453828  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0460  short chain dehydrogenase  50.68 
 
 
291 aa  292  5e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>