More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0126 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
298 aa  602  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  87.76 
 
 
304 aa  524  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.98 
 
 
301 aa  387  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.03 
 
 
308 aa  338  7e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278854  normal  0.143787 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.82 
 
 
293 aa  331  8e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116516  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.06 
 
 
288 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207761 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.25 
 
 
298 aa  325  5e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.96 
 
 
288 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1292  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.75 
 
 
339 aa  321  8e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1317  Short-chain dehydrogenase  60.51 
 
 
288 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169913  normal  0.0434292 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.78 
 
 
288 aa  316  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306467  normal  0.765133 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.94 
 
 
292 aa  315  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.082877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3986  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.18 
 
 
297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.4 
 
 
335 aa  311  9e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000556089  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.69 
 
 
286 aa  311  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.066838  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.21 
 
 
337 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.77 
 
 
333 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752467  normal  0.0103168 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0756  twin-arginine translocation pathway signal  55.21 
 
 
328 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.21 
 
 
328 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.7 
 
 
340 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.395332  normal  0.413116 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.01 
 
 
333 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828162  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2411  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.79 
 
 
286 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.39 
 
 
297 aa  308  8e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.68 
 
 
299 aa  307  1.0000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.74 
 
 
300 aa  306  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15410  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  58.16 
 
 
313 aa  306  3e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170308  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.12 
 
 
292 aa  306  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381228  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0067  Short-chain alcohol dehydrogenase  50.7 
 
 
296 aa  306  3e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.8 
 
 
293 aa  305  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.8 
 
 
293 aa  305  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.07 
 
 
286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.06 
 
 
291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791141  normal  0.178884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4720  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.93 
 
 
290 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.9 
 
 
298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.795136 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.03 
 
 
285 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2677  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  56.79 
 
 
286 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.71 
 
 
335 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.63 
 
 
297 aa  301  7.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1917  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  52.1 
 
 
293 aa  301  9e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.58 
 
 
290 aa  301  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.424888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.58 
 
 
290 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0102101 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.43 
 
 
334 aa  301  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3897  oxidoreductase NAD(P)-binding subunit  53.38 
 
 
294 aa  299  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.36 
 
 
292 aa  298  6e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0684702 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3415  oxidoreductase  51.53 
 
 
298 aa  298  7e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.07 
 
 
285 aa  296  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.359984 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2695  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.96 
 
 
285 aa  296  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.71 
 
 
285 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.798039  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.55 
 
 
285 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0775551 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1134  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.45 
 
 
285 aa  295  7e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.62 
 
 
285 aa  295  8e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.64 
 
 
280 aa  294  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05560  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  52.54 
 
 
303 aa  294  1e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.62 
 
 
285 aa  294  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  53.93 
 
 
285 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.612253  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.18 
 
 
299 aa  293  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.38 
 
 
285 aa  292  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539155  normal  0.142405 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.43 
 
 
293 aa  292  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.133433  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5588  dehydrogenase  53.62 
 
 
285 aa  292  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3340  oxidoreductase  52.08 
 
 
294 aa  292  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.461331 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.56 
 
 
294 aa  292  5e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.99 
 
 
285 aa  292  5e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.93 
 
 
285 aa  292  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3289  oxidoreductase  51.9 
 
 
294 aa  291  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.57 
 
 
285 aa  291  6e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02878  oxidoreductase  51.56 
 
 
294 aa  291  7e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4315  oxidoreductase  51.56 
 
 
294 aa  291  7e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3432  oxidoreductase  51.56 
 
 
294 aa  291  7e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3182  oxidoreductase  51.56 
 
 
294 aa  291  7e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3472  oxidoreductase  51.56 
 
 
294 aa  291  7e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3506  oxidoreductase  51.74 
 
 
294 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0691  oxidoreductase  51.21 
 
 
294 aa  290  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3405  oxidoreductase  51.74 
 
 
294 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.441834 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3331  oxidoreductase  51.74 
 
 
294 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.9 
 
 
288 aa  290  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3411  oxidoreductase  51.74 
 
 
294 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19840  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  54.55 
 
 
297 aa  289  4e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0858  Short-chain alcohol dehydrogenase  51.43 
 
 
289 aa  289  4e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.38 
 
 
286 aa  288  6e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.984934 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.38 
 
 
286 aa  288  9e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35800  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  57.09 
 
 
285 aa  288  9e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.05 
 
 
335 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927114  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6586  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.05 
 
 
335 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830153  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.02 
 
 
295 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.14 
 
 
286 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453828  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.02 
 
 
295 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.546475  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.34 
 
 
295 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0346785  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.77 
 
 
285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.402229  normal  0.230445 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.65 
 
 
284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.77 
 
 
285 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.319892  normal  0.963036 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.5 
 
 
285 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000245222 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2744  short chain dehydrogenase  53.6 
 
 
334 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0520687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.21 
 
 
285 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0919  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.42 
 
 
285 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.46 
 
 
285 aa  281  9e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.43 
 
 
286 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.22 
 
 
286 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
287 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1180  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.36 
 
 
293 aa  280  3e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22650  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  53.65 
 
 
306 aa  280  3e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>