More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6701 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
285 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539155  normal  0.142405 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  94.04 
 
 
285 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0775551 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.72 
 
 
286 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5588  dehydrogenase  79.3 
 
 
285 aa  479  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.95 
 
 
285 aa  477  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.3 
 
 
285 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000245222 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.03 
 
 
286 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.6 
 
 
285 aa  465  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.3 
 
 
311 aa  463  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.14 
 
 
285 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.402229  normal  0.230445 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.09 
 
 
285 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.319892  normal  0.963036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.03 
 
 
286 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453828  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0919  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.74 
 
 
285 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.33 
 
 
285 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.359984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.28 
 
 
285 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.28 
 
 
285 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.28 
 
 
286 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1317  Short-chain dehydrogenase  71.63 
 
 
288 aa  424  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169913  normal  0.0434292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.18 
 
 
286 aa  418  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.88 
 
 
286 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.67 
 
 
288 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306467  normal  0.765133 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.28 
 
 
288 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1134  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.77 
 
 
285 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.19 
 
 
300 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2411  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.83 
 
 
286 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.72 
 
 
298 aa  371  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.795136 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.79 
 
 
292 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0684702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.11 
 
 
285 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.798039  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.94 
 
 
285 aa  368  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.92 
 
 
288 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2695  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.05 
 
 
285 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2677  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  61.48 
 
 
286 aa  362  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  60.35 
 
 
285 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.612253  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.35 
 
 
285 aa  361  8e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.81 
 
 
280 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.4 
 
 
285 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4720  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.44 
 
 
290 aa  347  1e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.09 
 
 
290 aa  343  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.424888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.09 
 
 
290 aa  344  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0102101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3986  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.09 
 
 
297 aa  340  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.95 
 
 
293 aa  337  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116516  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.63 
 
 
291 aa  331  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791141  normal  0.178884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.42 
 
 
297 aa  329  3e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.39 
 
 
298 aa  328  8e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5938  oxidoreductase NAD(P)-binding subunit  81.08 
 
 
206 aa  324  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.12 
 
 
295 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0346785  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.12 
 
 
293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.133433  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.41 
 
 
295 aa  318  7e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.546475  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.69 
 
 
295 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19840  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  55.12 
 
 
297 aa  316  3e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.96 
 
 
333 aa  315  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752467  normal  0.0103168 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.09 
 
 
333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828162  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.06 
 
 
292 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.082877 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0632  short chain dehydrogenase  55.51 
 
 
288 aa  311  5.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000680928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0667  short chain dehydrogenase  53.76 
 
 
288 aa  311  9e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0655  short chain dehydrogenase  54.12 
 
 
288 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000332724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0712  short chain dehydrogenase  54.12 
 
 
288 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0663  short chain dehydrogenase  54.12 
 
 
288 aa  310  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4525  short chain dehydrogenase  53.41 
 
 
288 aa  310  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.193288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.36 
 
 
285 aa  310  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0748  short chain dehydrogenase  54.12 
 
 
288 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0824  short chain dehydrogenase  54.12 
 
 
288 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.87827e-53 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55 
 
 
335 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.29 
 
 
292 aa  308  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381228  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0805  short chain dehydrogenase  54.12 
 
 
288 aa  308  5e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0818  short chain dehydrogenase  53.76 
 
 
288 aa  308  5e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0912  short chain dehydrogenase  53.05 
 
 
288 aa  308  8e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.02 
 
 
340 aa  304  9.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.395332  normal  0.413116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.23 
 
 
288 aa  303  3.0000000000000004e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.77 
 
 
308 aa  301  8.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278854  normal  0.143787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.74 
 
 
335 aa  300  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000556089  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0460  short chain dehydrogenase  51.97 
 
 
291 aa  298  7e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.52 
 
 
337 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.31 
 
 
286 aa  297  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.984934 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.67 
 
 
286 aa  297  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.57 
 
 
284 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.73 
 
 
285 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0756  twin-arginine translocation pathway signal  53.17 
 
 
328 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.17 
 
 
328 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2925  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  53.65 
 
 
296 aa  295  5e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3415  oxidoreductase  51.41 
 
 
298 aa  295  7e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36870  putative short-chain dehydrogenase  52.35 
 
 
286 aa  295  7e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.14 
 
 
304 aa  294  9e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52 
 
 
287 aa  294  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1292  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.6 
 
 
339 aa  293  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.38 
 
 
298 aa  292  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
334 aa  292  5e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4753  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.51 
 
 
284 aa  291  6e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163262  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.82 
 
 
301 aa  291  8e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17140  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  52.54 
 
 
307 aa  290  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391545  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.73 
 
 
285 aa  290  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566144  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.51 
 
 
335 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927114  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  51.1 
 
 
286 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6586  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.51 
 
 
335 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830153  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.68 
 
 
306 aa  290  3e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22650  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  52.84 
 
 
306 aa  290  3e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06640  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  54.01 
 
 
309 aa  289  3e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.64 
 
 
287 aa  289  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5297  short chain dehydrogenase  50.36 
 
 
317 aa  288  6e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.26 
 
 
297 aa  288  6e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>