More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2415 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
255 aa  491  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0149136  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
261 aa  195  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00435006  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 
262 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 
261 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.67 
 
 
250 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.83 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354255 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
262 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.46 
 
 
263 aa  171  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 
253 aa  171  9e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 
261 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.274647 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
260 aa  168  9e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
259 aa  167  2e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0333473 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
260 aa  167  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.658304  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.85 
 
 
254 aa  166  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.131558 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.54 
 
 
267 aa  166  5e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.16 
 
 
263 aa  165  8e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.544381  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 
264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.933978  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0311  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
262 aa  161  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
262 aa  158  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
260 aa  157  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2072  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
259 aa  154  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
260 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.389039  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
261 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1391  NAD/NADP dependent oxidoreductase  40.23 
 
 
261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
261 aa  152  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
261 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.41 
 
 
262 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
259 aa  149  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199675 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.861645  normal  0.226141 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3257  putative 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  37.5 
 
 
259 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.418945 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154867  normal  0.0871554 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
253 aa  145  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.196322  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
260 aa  144  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 
261 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07435  putative short-chain dehydrogenase/reductase  36.33 
 
 
269 aa  142  7e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.492431  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
265 aa  142  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
261 aa  141  9e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.199007  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1821  short chain dehydrogenase  36.72 
 
 
264 aa  141  9e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
262 aa  139  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 
260 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.482868  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209308  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
262 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.80685  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 
267 aa  138  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0986  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
278 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
259 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00522333  unclonable  4.08177e-18 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
262 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 
271 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5619  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
277 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0753007  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
259 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.400056 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
259 aa  135  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000437524  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
259 aa  136  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.560822  normal  0.0105475 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.53 
 
 
261 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433657 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
285 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0641216  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163833  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.26 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
259 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336154  normal  0.942948 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
259 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
259 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
259 aa  131  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2186  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  38.13 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12220  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
248 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
237 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
262 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
231 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
247 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3419  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.38 
 
 
261 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 
272 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460679  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.930185  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1510  short chain dehydrogenase  36.86 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1983  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0315057  normal  0.582541 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
269 aa  126  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
263 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1017  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.36 
 
 
325 aa  125  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
258 aa  125  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1388  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.89 
 
 
259 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1882  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.89 
 
 
259 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1243  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.89 
 
 
259 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00809972  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1234  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.89 
 
 
259 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1078  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.89 
 
 
259 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.296983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0361  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.89 
 
 
259 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0730868  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0789  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.89 
 
 
259 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0355352  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1052  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.82 
 
 
249 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.595942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1210  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.88 
 
 
260 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.475284  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1549  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.58 
 
 
256 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.755021  normal  0.0732126 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
250 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.328906 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0982  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.8 
 
 
249 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.629035  normal  0.0572265 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
259 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0917  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.19 
 
 
249 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.213986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>