More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0159 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 253 aa  497  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.29 
 
 		 253 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.44 
 
 		 250 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.03 
 
 		 251 aa  240  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0607199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.4 
 
 		 249 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0428484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  43.08 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.95 
 
 		 256 aa  192  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  43.87 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  42.25 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  41.86 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  41.11 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.32 
 
 		 272 aa  178  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.777367  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1946  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.9 
 
 		 262 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  41.8 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  39.2 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  41.47 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  45.34 
 
 		 251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 249 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  41.11 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  38.55 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 		 267 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 249 aa  169  6e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.76 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  37.75 
 
 		 247 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.849975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3471  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 254 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 		 254 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.36 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 		 251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0865  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0890  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7167  short chain dehydrogenase  39.6 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 250 aa  162  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 260 aa  162  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000468902  normal  0.0104317 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 		 257 aa  161  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2039  short chain dehydrogenase  39.44 
 
 		 255 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  40.08 
 
 		 255 aa  162  7e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 252 aa  161  8.000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 		 251 aa  161  9e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 		 250 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.991261  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.34144  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0264  putative short-chain dehydrogenase  42.15 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1270  Short-chain dehydrogenase  41.74 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.56 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0136754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2263  short chain dehydrogenase  39.04 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00829126  normal  0.0703688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 256 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 		 270 aa  159  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 		 246 aa  158  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4456  short chain dehydrogenase  41.2 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.968852  decreased coverage  0.00124263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2283  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  40.8 
 
 		 251 aa  156  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.890359 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4626  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130325  normal  0.180414 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000368197  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1752  short chain dehydrogenase  39.68 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 		 249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4858  glucose-1-dehydrogenase  33.98 
 
 		 261 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 		 250 aa  155  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  38.65 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 		 258 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43180  short chain dehydrogenase  41.9 
 
 		 253 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350844 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 254 aa  154  9e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4852  glucose-1-dehydrogenase  33.98 
 
 		 261 aa  154  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 257 aa  154  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4612  glucose-1-dehydrogenase  33.98 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4448  glucose-1-dehydrogenase  33.98 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4968  glucose-1-dehydrogenase  33.98 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0408  glucose-1-dehydrogenase  33.98 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.32 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790867  normal  0.270985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>