More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11298 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11298  short chain dehydrogenase  100 
 
 
232 aa  471  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.65 
 
 
233 aa  238  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.79 
 
 
227 aa  202  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1057  short chain dehydrogenase; 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  45.45 
 
 
230 aa  198  5e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.474453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.47 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 
244 aa  135  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
248 aa  135  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.112412 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0291  hypothetical protein  34.36 
 
 
232 aa  118  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.15 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
237 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0264  hypothetical protein  35.68 
 
 
232 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.54 
 
 
246 aa  105  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.54 
 
 
246 aa  105  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 
268 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0259  hypothetical protein  35.68 
 
 
232 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.22 
 
 
234 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221746  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 
237 aa  104  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 
233 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 
233 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0508  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.71 
 
 
248 aa  102  5e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3677  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 
233 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 
233 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.929403  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 
234 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0991034  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.08 
 
 
249 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.29 
 
 
233 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3657  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
290 aa  99  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 
245 aa  99.4  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.831368  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34089  predicted protein  30.33 
 
 
268 aa  99  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
252 aa  98.6  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.49 
 
 
241 aa  98.2  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550134  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7123  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.99 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1843  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  26.38 
 
 
234 aa  97.4  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.1 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.36 
 
 
241 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2407  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.17 
 
 
246 aa  96.3  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 
262 aa  96.3  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.86 
 
 
247 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.86 
 
 
247 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  normal  0.265032 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1231  acetoacetyl-CoA reductase  31.8 
 
 
247 aa  95.5  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0027  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.29 
 
 
245 aa  95.5  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  28.39 
 
 
254 aa  95.5  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1867  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.63 
 
 
247 aa  95.1  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0330312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3267  putative short chain dehydrogenase/reductase  35.48 
 
 
249 aa  95.1  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 
256 aa  95.1  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 
262 aa  95.1  8e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25957  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05365  acetoacetyl-CoA reductase  31.02 
 
 
268 aa  95.1  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.36 
 
 
237 aa  95.1  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000520  acetoacetyl-CoA reductase  30.2 
 
 
246 aa  94.4  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0030  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  29.29 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1614  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.87 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0547221  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1259  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.63 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
251 aa  94.4  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.87 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.842348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1429  acetoacetyl-CoA reductase  31.38 
 
 
247 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3976  acetoacetyl-CoA reductase  31.38 
 
 
247 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1368  acetoacetyl-CoA reductase  31.38 
 
 
247 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.194105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1230  acetoacetyl-CoA reductase  31.38 
 
 
247 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.824936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1207  acetoacetyl-CoA reductase  31.38 
 
 
247 aa  93.6  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1209  acetoacetyl-CoA reductase  31.38 
 
 
247 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00888886  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1554  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.76 
 
 
276 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1330  acetoacetyl-CoA reductase  31.38 
 
 
247 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0669  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.22 
 
 
247 aa  93.6  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.154574  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08226  putative 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  30.33 
 
 
269 aa  94.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3818  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  28.69 
 
 
245 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0470155 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 
249 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00384997  hitchhiker  0.000208801 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1405  acetoacetyl-CoA reductase  31.38 
 
 
247 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.27 
 
 
248 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1470  acetoacetyl-CoA reductase  31.38 
 
 
247 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.97 
 
 
254 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.46 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.81 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 
253 aa  92.8  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1360  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.46 
 
 
243 aa  92.8  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000468393  normal  0.0479743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2277  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.45 
 
 
234 aa  92.8  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000536338  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.53 
 
 
250 aa  92.4  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.1 
 
 
247 aa  92.4  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1164  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase (3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase)  27.62 
 
 
239 aa  92.8  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.115217  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4487  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
250 aa  92  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027964 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2122  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.97 
 
 
245 aa  92  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000118784  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4773  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.94 
 
 
242 aa  92.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3696  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.94 
 
 
242 aa  92.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.709144 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4354  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
250 aa  92  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0359  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.12 
 
 
242 aa  92  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 
251 aa  92  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.95 
 
 
251 aa  92  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.75 
 
 
243 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.76 
 
 
259 aa  91.7  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2721  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1043  acetoacetyl-CoA reductase  32.22 
 
 
247 aa  90.9  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.8589  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1581  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  28.4 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00017269  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.78 
 
 
244 aa  90.9  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.73 
 
 
245 aa  91.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>