More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1061 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 244 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.112412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  98.36 
 
 		 244 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  91.94 
 
 		 248 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.55 
 
 		 248 aa  262  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11298  short chain dehydrogenase  39.17 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1057  short chain dehydrogenase; 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.93 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.474453 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.98 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.831368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 		 267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27381  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  32.66 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0291  hypothetical protein  31.15 
 
 		 232 aa  105  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0027  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.64 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0030  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  32.64 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4730  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  38.11 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_51114  predicted protein  34.02 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000350545  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7370  short-chain alcohol dehydrogenase  33.47 
 
 		 247 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 		 243 aa  101  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0160173  normal  0.32816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3677  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 248 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1384  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.981738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.929403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4487  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027964 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0259  hypothetical protein  33.74 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  32.78 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4354  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.443482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.73 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0512455  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.442854  normal  0.93857 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 		 249 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 		 258 aa  99.4  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 		 254 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0380  ATPase  32.53 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.647768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  32.26 
 
 		 249 aa  99  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 249 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13520  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 		 314 aa  99  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0292785 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 		 257 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.429705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 		 257 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30491  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 		 251 aa  98.6  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.893367  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 		 248 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 		 248 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 249 aa  98.6  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 		 247 aa  98.6  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4098  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 249 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4268  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 249 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  0.279758 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0696  glucose 1-dehydrogenase  34.84 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0264  hypothetical protein  32.38 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.445893 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7235  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 263 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126511 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25957  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.731962 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.16 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.58 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  normal  0.265032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00521448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34089  predicted protein  31.82 
 
 		 268 aa  96.7  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 		 251 aa  96.3  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 259 aa  96.3  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0974  acetoin reductase  31.89 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4111  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 		 254 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 274 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 		 248 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3998  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 		 254 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0400117  normal  0.51074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 		 249 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  35.74 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0908  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.6 
 
 		 257 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.99 
 
 		 244 aa  95.5  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 255 aa  95.5  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>