More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5818 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
260 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4572  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.42 
 
 
230 aa  223  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0571  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
287 aa  192  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.044824  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
263 aa  169  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
282 aa  146  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
248 aa  143  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.84 
 
 
256 aa  142  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00394845  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  33.86 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2039  short chain dehydrogenase  32.69 
 
 
255 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111409  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
258 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1752  short chain dehydrogenase  32.43 
 
 
254 aa  126  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
252 aa  125  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00739159  hitchhiker  0.000116023 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 
253 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4584  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 
252 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.5 
 
 
249 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.43 
 
 
248 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1494  short chain dehydrogenase  31.8 
 
 
255 aa  122  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000180405  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 
269 aa  123  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 
252 aa  123  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 
254 aa  122  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3471  short chain dehydrogenase  33.21 
 
 
254 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0563  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
252 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0890  short chain dehydrogenase  32.83 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13982  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0865  short chain dehydrogenase  32.83 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  29.34 
 
 
247 aa  119  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  30.27 
 
 
253 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
270 aa  120  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  32.3 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  29.96 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  32.67 
 
 
256 aa  119  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3492  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 
256 aa  118  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2263  short chain dehydrogenase  31.42 
 
 
255 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00829126  normal  0.0703688 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1429  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.59 
 
 
256 aa  118  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.865814 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0620  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
254 aa  118  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 
250 aa  118  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  32.05 
 
 
272 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  32.05 
 
 
272 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.46 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  28.96 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.86 
 
 
248 aa  116  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
258 aa  116  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.62 
 
 
253 aa  116  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2588  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.66 
 
 
248 aa  116  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699646  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.1 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
262 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 
254 aa  115  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
255 aa  116  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.12 
 
 
246 aa  115  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0863  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 
264 aa  115  6e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 
253 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  31.4 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  30.74 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.85 
 
 
249 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.45 
 
 
285 aa  115  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.07 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000166105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.98 
 
 
252 aa  115  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  29.57 
 
 
261 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 
250 aa  115  8.999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 
252 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
257 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.95 
 
 
246 aa  115  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  31.5 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.62 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 
248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.201742  hitchhiker  0.000163271 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496864  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1270  Short-chain dehydrogenase  34.4 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1085  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.26 
 
 
248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.021981  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  30.59 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.317025 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.13 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2383  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  32.68 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
257 aa  113  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 
251 aa  113  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 
244 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000275266  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2403  gluconate 5-dehydrogenase  32.81 
 
 
258 aa  113  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.525317  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 
252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1518  short chain dehydrogenase  31.01 
 
 
254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0138518 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 
249 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790867  normal  0.270985 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4612  glucose-1-dehydrogenase  29.57 
 
 
261 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548081  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.35 
 
 
252 aa  112  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000391653  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 
252 aa  112  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4968  glucose-1-dehydrogenase  29.57 
 
 
261 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  31.52 
 
 
259 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3977  putative 2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.85 
 
 
255 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686311  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>