More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2515 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
263 aa  524  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.59 
 
 
256 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00394845  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
260 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.08 
 
 
250 aa  174  9e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
252 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.86 
 
 
262 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
248 aa  166  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.61 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  38.82 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3193  short chain dehydrogenase  40 
 
 
255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
246 aa  162  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
257 aa  161  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.68 
 
 
255 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.8 
 
 
249 aa  161  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.68 
 
 
255 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.25 
 
 
246 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.15 
 
 
246 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
246 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  39.69 
 
 
255 aa  160  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
258 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.31 
 
 
251 aa  159  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000407954 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
256 aa  159  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.41 
 
 
261 aa  159  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 
252 aa  159  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.55 
 
 
246 aa  159  6e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.58 
 
 
244 aa  159  6e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.25 
 
 
246 aa  159  6e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
250 aa  158  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
256 aa  158  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
256 aa  158  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 
258 aa  157  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 
252 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.48 
 
 
265 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
253 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3076  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
285 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1634  short chain dehydrogenase  39.45 
 
 
265 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213832  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
252 aa  156  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
258 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 
253 aa  155  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.64 
 
 
254 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.64 
 
 
254 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699646  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.15 
 
 
246 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  39 
 
 
257 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
252 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  35.16 
 
 
247 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  34.38 
 
 
247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.45 
 
 
249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
251 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.8 
 
 
247 aa  152  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  40.3 
 
 
256 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
253 aa  152  5e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0571  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.044824  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5100  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR family protein  37.55 
 
 
261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.917841  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
253 aa  152  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
252 aa  152  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
247 aa  152  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  36.64 
 
 
255 aa  152  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
252 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
244 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.8 
 
 
239 aa  151  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
251 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
253 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0620  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
254 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
254 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  38.17 
 
 
257 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  38.17 
 
 
257 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  38.17 
 
 
257 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 
249 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496864  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
261 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 
261 aa  150  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
251 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
251 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.69 
 
 
248 aa  149  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  37.16 
 
 
257 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 
261 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
256 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 
254 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.572061  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
270 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 
262 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
249 aa  149  5e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
277 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
248 aa  149  5e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
261 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
262 aa  148  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0537  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.38 
 
 
256 aa  149  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
253 aa  148  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.024976  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
275 aa  148  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0972  putative short-chain dehydrogenase/reductase  39.85 
 
 
268 aa  148  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000126906  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
256 aa  148  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  36.72 
 
 
254 aa  148  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0416  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.45 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  39.77 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>