More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1920 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
252 aa  504  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0639  putative dehydrogenase  59.61 
 
 
258 aa  293  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  normal  0.0579456 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.21 
 
 
261 aa  222  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 
237 aa  177  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
262 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
251 aa  168  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
248 aa  161  8.000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
257 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  37.85 
 
 
257 aa  159  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.96 
 
 
246 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.55 
 
 
246 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
251 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
253 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
254 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.71 
 
 
244 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
254 aa  153  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 
255 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
275 aa  152  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
267 aa  151  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.1 
 
 
254 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
254 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
277 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
256 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
258 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
251 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1935  putative short-chain alcohol dehydrogenase  38.58 
 
 
267 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000230306  normal  0.160662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
252 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
250 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
266 aa  149  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.388787  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3615  putative dehydrogenase  37.6 
 
 
291 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.427411  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
254 aa  149  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.4 
 
 
248 aa  148  8e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.197864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
268 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5100  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR family protein  36.61 
 
 
261 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.917841  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
257 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2045  short chain dehydrogenase  36.02 
 
 
272 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
250 aa  145  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
264 aa  145  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
249 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
252 aa  144  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
246 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.33 
 
 
245 aa  144  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
258 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.73 
 
 
245 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
257 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.08 
 
 
255 aa  143  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0948  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.5 
 
 
249 aa  143  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000118605  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
256 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
285 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
285 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0197  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.33 
 
 
245 aa  143  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.55 
 
 
247 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0991  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.29 
 
 
291 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.123495  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1971  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.29 
 
 
285 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0942003  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1370  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.29 
 
 
285 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
262 aa  143  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0972  putative short-chain dehydrogenase/reductase  34.98 
 
 
268 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000126906  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2253  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.29 
 
 
285 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3020  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.29 
 
 
285 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1278  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.29 
 
 
285 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.93331  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3149  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.29 
 
 
285 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.653242  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000395  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  36.95 
 
 
252 aa  142  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.36672  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  35.08 
 
 
286 aa  142  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
285 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0516293 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 
259 aa  142  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
252 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1283  short-chain type dehydrogenase/reductase  36.96 
 
 
277 aa  142  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
277 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
287 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 
261 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  37.89 
 
 
257 aa  141  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0701  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.63 
 
 
247 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000555171 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36 
 
 
250 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223454  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.06102  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
252 aa  140  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.99 
 
 
246 aa  140  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0012  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.77 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.34144  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1818  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
255 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
246 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 
258 aa  139  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
275 aa  139  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 
278 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
252 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>