More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1935 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1935  putative short-chain alcohol dehydrogenase  100 
 
 
267 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000230306  normal  0.160662 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0972  putative short-chain dehydrogenase/reductase  83.46 
 
 
268 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000126906  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.04 
 
 
266 aa  371  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0968  putative short-chain dehydrogenase/reductase  48.8 
 
 
255 aa  251  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0940  putative short-chain dehydrogenase  47.53 
 
 
266 aa  251  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.33 
 
 
278 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 
262 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.92 
 
 
267 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.92 
 
 
290 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269843 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.13 
 
 
262 aa  228  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.06102  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.17 
 
 
267 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365556  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.33 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0435882  hitchhiker  0.0000139106 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.33 
 
 
273 aa  209  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.824236  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.59 
 
 
272 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.63 
 
 
267 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.31 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7160  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.49 
 
 
262 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254231  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5379  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.38 
 
 
269 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.122542  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
287 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0920178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.49 
 
 
262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.06 
 
 
274 aa  175  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709092  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.84 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 
254 aa  169  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.53 
 
 
255 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.53 
 
 
255 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.53 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
246 aa  161  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0197  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.16 
 
 
245 aa  161  9e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10005  hypothetical protein  35.9 
 
 
289 aa  160  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
246 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  41.95 
 
 
257 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.7 
 
 
246 aa  161  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 
257 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2588  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.15 
 
 
248 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 
256 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.47 
 
 
245 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 
268 aa  159  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.31 
 
 
246 aa  159  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 
272 aa  159  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0477123  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.77 
 
 
244 aa  158  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.3 
 
 
245 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 
252 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0943  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.07 
 
 
246 aa  156  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000752112  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
262 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.37 
 
 
247 aa  155  9e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0131  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.76 
 
 
245 aa  154  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120855  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1085  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.87 
 
 
248 aa  154  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.021981  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0167  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.62 
 
 
245 aa  154  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.619009  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.98 
 
 
248 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2045  short chain dehydrogenase  36.64 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.52 
 
 
245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.3 
 
 
261 aa  152  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.62 
 
 
247 aa  151  8.999999999999999e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  37.26 
 
 
272 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
247 aa  151  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
251 aa  151  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  37.26 
 
 
272 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
283 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
250 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.62 
 
 
261 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
250 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 
258 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1239  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.61 
 
 
248 aa  149  4e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
252 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4948  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
270 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.617034  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 
269 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
253 aa  149  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.26 
 
 
249 aa  148  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 
249 aa  148  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.519285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  36.26 
 
 
254 aa  148  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0695  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.21 
 
 
247 aa  148  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0265  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.15 
 
 
248 aa  148  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2110  short chain dehydrogenase  36.58 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10933  conserved hypothetical protein  37.93 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1466  short-chain alcohol dehydrogenase  39.77 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137862  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
248 aa  146  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3774  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
258 aa  146  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.96 
 
 
248 aa  146  3e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  39.16 
 
 
269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 
253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.12 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.78 
 
 
247 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
250 aa  145  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1744  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.74 
 
 
245 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1531  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.68 
 
 
249 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356437 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0659  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.41 
 
 
245 aa  144  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.372694  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1010  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 
253 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.91 
 
 
246 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 
252 aa  143  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
250 aa  143  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  33.59 
 
 
257 aa  143  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1563  short-chain alcohol dehydrogenase  35.85 
 
 
266 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147181  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.54 
 
 
249 aa  143  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0705  putative short-chain dehydrogenase/reductase  34.76 
 
 
256 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539769  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.98 
 
 
246 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>