More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3439 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.97 
 
 
261 aa  236  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 
252 aa  186  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
252 aa  165  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0639  putative dehydrogenase  41.94 
 
 
258 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  normal  0.0579456 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
244 aa  151  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
254 aa  148  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  38.13 
 
 
269 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
260 aa  146  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  38.13 
 
 
269 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
251 aa  145  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2753  short chain dehydrogenase  39.68 
 
 
265 aa  142  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.26681  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.82 
 
 
250 aa  141  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.24 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.34 
 
 
239 aa  139  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  38.34 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.24 
 
 
247 aa  138  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203668  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
246 aa  138  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
246 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0137  short chain dehydrogenase  39.15 
 
 
260 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600475  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 
263 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0620  short chain dehydrogenase  39.15 
 
 
260 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
255 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  37.94 
 
 
259 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  37.94 
 
 
269 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  37.94 
 
 
259 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  37.94 
 
 
259 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0588  short chain dehydrogenase  39.15 
 
 
260 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194347  normal  0.0391008 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  37.94 
 
 
259 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
255 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  37.94 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
252 aa  135  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
269 aa  135  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
269 aa  135  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  39.53 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3615  putative dehydrogenase  38.25 
 
 
291 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.427411  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
246 aa  134  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.203579  normal  0.799434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.65 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.997672 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0521  short chain dehydrogenase  38.76 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.847891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.6 
 
 
246 aa  132  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
253 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.25 
 
 
249 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0242  Short-chain alcohol dehydrogenase  35 
 
 
253 aa  133  3e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
264 aa  132  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
255 aa  132  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
245 aa  132  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
275 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.126058  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  36.03 
 
 
255 aa  132  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0545  short chain dehydrogenase  38.43 
 
 
259 aa  131  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.074184  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
274 aa  131  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  38.21 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  35.6 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235885 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.01 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.01 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  35.46 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  35.46 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0201969  normal  0.963829 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  35.46 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  34 
 
 
258 aa  129  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.77 
 
 
244 aa  130  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4142  short chain dehydrogenase  33.07 
 
 
272 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553245  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
254 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3412  short chain dehydrogenase  37.01 
 
 
258 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0947163  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11468  acetoin(diacetyl)reductase  37.7 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0328388  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
255 aa  128  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
254 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  36.61 
 
 
258 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2791  short chain dehydrogenase  39.43 
 
 
256 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2818  short chain dehydrogenase  39.43 
 
 
256 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.22 
 
 
245 aa  128  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 
277 aa  128  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
250 aa  128  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2835  short chain dehydrogenase  39.43 
 
 
256 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
244 aa  128  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.291511  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>