More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1634 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1634  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 265 aa  527  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213832  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  81.75 
 
 		 255 aa  414  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  79.37 
 
 		 255 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  79.05 
 
 		 254 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  77.56 
 
 		 258 aa  393  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  74.61 
 
 		 259 aa  390  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2281  short chain dehydrogenase  73.12 
 
 		 257 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1800  short chain dehydrogenase  76.83 
 
 		 260 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.837228 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  70.87 
 
 		 257 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  70.87 
 
 		 257 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  71.26 
 
 		 257 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  70.87 
 
 		 257 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3193  short chain dehydrogenase  67.33 
 
 		 255 aa  340  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.25 
 
 		 257 aa  269  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 		 283 aa  249  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  48.83 
 
 		 257 aa  246  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00370  fatty acid beta-oxidation-related protein, putative  47.06 
 
 		 292 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.170907  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06655  short-chain dehydrogenase/reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03520)  47.13 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.84 
 
 		 256 aa  228  8e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.64 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  43.08 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  43.43 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  43.03 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.8 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.8 
 
 		 246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 		 251 aa  182  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000195486  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 		 252 aa  181  8.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  41.11 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 		 246 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  43.43 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  42.63 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  42.63 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.08 
 
 		 249 aa  176  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  42.63 
 
 		 253 aa  176  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.65 
 
 		 253 aa  175  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 		 244 aa  175  7e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  37.6 
 
 		 247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 		 250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  37.6 
 
 		 247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.27 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 247 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 		 252 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1283  short-chain type dehydrogenase/reductase  38.06 
 
 		 277 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.86 
 
 		 254 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 		 246 aa  166  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 		 252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 		 257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  41.76 
 
 		 259 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  41.76 
 
 		 259 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  41.76 
 
 		 259 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.4 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  41.76 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  41.76 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.58 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  41.76 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  40.66 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  40.36 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3076  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43180  short chain dehydrogenase  43.03 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 		 267 aa  162  6e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2110  short chain dehydrogenase  43.08 
 
 		 253 aa  162  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 		 257 aa  162  7e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 		 248 aa  161  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000355798  normal  0.0941785 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 		 261 aa  161  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1946  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.68 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 		 250 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  37.45 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04660  2-hydroxycyclohexane-1-carbonyl-CoA dehydrogenase  41.96 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>