More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_34089 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009357  OSTLU_34089  predicted protein  100 
 
 
268 aa  556  1e-157  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_51114  predicted protein  50 
 
 
268 aa  251  1e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.43 
 
 
256 aa  240  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  45.63 
 
 
267 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21608  predicted protein  43.89 
 
 
276 aa  202  4e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3595  tropinone reductase  40.23 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.855153  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1875  tropinone reductase  40.62 
 
 
258 aa  192  4e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1940  tropinone reductase  40.62 
 
 
258 aa  192  6e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.803191  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04045  tropinone reductase  37.89 
 
 
258 aa  191  9e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2389  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.6 
 
 
255 aa  156  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
264 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
257 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
255 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
255 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  33.33 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  34.92 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000166105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5878  gluconate 5-dehydrogenase  35.09 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.854497  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  34.27 
 
 
257 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  33.73 
 
 
255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
255 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
251 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
257 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
252 aa  149  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
255 aa  149  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0755029  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
252 aa  148  8e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0919  putative oxidoreductase  36.76 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
257 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0563  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
252 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
257 aa  146  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
260 aa  145  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
257 aa  145  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.02 
 
 
251 aa  145  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 
257 aa  145  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
257 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
257 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
252 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2136  gluconate 5-dehydrogenase  32.57 
 
 
256 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.510387  normal  0.0477177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3977  putative 2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  34.4 
 
 
255 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686311  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4511  gluconate 5-dehydrogenase  32.67 
 
 
254 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0293  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
257 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1154  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  34.68 
 
 
253 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000294561  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  31.85 
 
 
254 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1540  gluconate 5-dehydrogenase  34.94 
 
 
255 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0166996  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0991  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  34.27 
 
 
253 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0118  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  34.11 
 
 
256 aa  142  7e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
265 aa  142  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222007  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
256 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2695  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  36.55 
 
 
277 aa  142  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
271 aa  142  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
263 aa  142  8e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1513  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  36.55 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.729699 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.242227  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.243411  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 
245 aa  139  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
257 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
258 aa  139  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3895  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.46 
 
 
248 aa  139  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.589012  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  31.73 
 
 
257 aa  138  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
251 aa  138  8.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
254 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0672528  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
254 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5273  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.65 
 
 
260 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251333 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
261 aa  138  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.718128 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
258 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0392  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  34.9 
 
 
258 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3288  gluconate 5-dehydrogenase  30.65 
 
 
254 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 
248 aa  137  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  32.66 
 
 
258 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5032  gluconate 5-dehydrogenase  34.68 
 
 
252 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
272 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.382394  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0396  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  34.9 
 
 
258 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
261 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0777  gluconate 5-dehydrogenase  35.04 
 
 
251 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618291  hitchhiker  0.00200145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4672  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.32 
 
 
253 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572467  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
256 aa  136  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.936397  normal  0.224474 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  33.86 
 
 
260 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
256 aa  136  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2043  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 
254 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
255 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
260 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0593655  normal  0.256231 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
260 aa  135  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
251 aa  135  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 
263 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.170949  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7123  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
249 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>