More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1007 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
233 aa  474  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11298  short chain dehydrogenase  53.65 
 
 
232 aa  238  5.999999999999999e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.83 
 
 
227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1057  short chain dehydrogenase; 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.83 
 
 
230 aa  181  9.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.474453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.71 
 
 
248 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0291  hypothetical protein  36.24 
 
 
232 aa  138  7e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.112412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
244 aa  134  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 
251 aa  131  9e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.07 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.03 
 
 
249 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0259  hypothetical protein  34.8 
 
 
232 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0264  hypothetical protein  34.36 
 
 
232 aa  121  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.64 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3231  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 
245 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304941  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.98 
 
 
246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.98 
 
 
246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.16 
 
 
252 aa  112  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 
251 aa  112  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2644  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.07 
 
 
247 aa  112  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.439694  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.16 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.99 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1060  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  31.28 
 
 
250 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000409861  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2799  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.96 
 
 
246 aa  109  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
247 aa  109  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  29.92 
 
 
249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.28 
 
 
254 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.93 
 
 
248 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2932  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.79 
 
 
250 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2840  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.79 
 
 
250 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.57 
 
 
250 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.57 
 
 
250 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
252 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  31.02 
 
 
248 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
233 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00988  dehydrogenase with different specificities  32.64 
 
 
250 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06178  dehydrogenase with different specificities  32.64 
 
 
250 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0668651  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
248 aa  107  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  29.13 
 
 
269 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 
257 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30491  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2748  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.38 
 
 
250 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
263 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.170949  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 
257 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.429705  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 
243 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 
245 aa  106  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.831368  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 
249 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
245 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1151  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.76 
 
 
234 aa  106  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.256582 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5343  carbonyl reductase  32.5 
 
 
242 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1843  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.76 
 
 
234 aa  105  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136671  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2430  short chain dehydrogenase  30.42 
 
 
248 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 
274 aa  105  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.485645  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
259 aa  105  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.53 
 
 
254 aa  105  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 
234 aa  105  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221746  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
241 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550134  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2263  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 
249 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412485  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1270  Short-chain dehydrogenase  31.15 
 
 
248 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.57 
 
 
246 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.75 
 
 
241 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 
255 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.58 
 
 
250 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2072  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.54 
 
 
247 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000027021  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 
248 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.16 
 
 
246 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 
261 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3531  short chain dehydrogenase  31.43 
 
 
250 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4196  short chain dehydrogenase  30.58 
 
 
252 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0824  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.61 
 
 
243 aa  103  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.45 
 
 
245 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2132  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.46 
 
 
244 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000343702  normal  0.0291609 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0505  short chain dehydrogenase  32.2 
 
 
246 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_002936  DET1277  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  30.45 
 
 
247 aa  103  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.038158  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34089  predicted protein  28.16 
 
 
268 aa  103  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2299  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.71 
 
 
245 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.85 
 
 
285 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 
264 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1613  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.39 
 
 
248 aa  103  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 
262 aa  103  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25957  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1941  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.04 
 
 
234 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0923131  normal  0.859754 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3207  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.24 
 
 
246 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.819769  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
256 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.1 
 
 
245 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0131  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.8 
 
 
245 aa  102  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120855  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1614  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.54 
 
 
253 aa  102  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0547221  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1360  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.13 
 
 
243 aa  102  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000468393  normal  0.0479743 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4719  short chain dehydrogenase  30.17 
 
 
252 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.358577 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 
254 aa  102  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.96 
 
 
245 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1384  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 
257 aa  102  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.981738  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09158  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01040)  31.97 
 
 
251 aa  102  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.3 
 
 
251 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3848  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 
245 aa  102  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810903  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.02 
 
 
248 aa  102  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11580  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.06 
 
 
248 aa  102  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.98 
 
 
262 aa  102  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2456  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.47 
 
 
254 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.291643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>