More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3231 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3231  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 245 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0505  short chain dehydrogenase  82.11 
 
 		 246 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2430  short chain dehydrogenase  70.97 
 
 		 248 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1926  short chain dehydrogenase  71.37 
 
 		 248 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00605891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1193  short chain dehydrogenase  70.97 
 
 		 248 aa  311  9e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2074  short chain dehydrogenase  70.97 
 
 		 248 aa  311  9e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0862  short chain dehydrogenase  70.97 
 
 		 248 aa  311  9e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.140204  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1913  short chain dehydrogenase  70.97 
 
 		 248 aa  311  9e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1636  short chain dehydrogenase  70.97 
 
 		 248 aa  311  9e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.140639  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0299  short chain dehydrogenase  70.97 
 
 		 248 aa  311  9e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.71932  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0339  short chain dehydrogenase  65.84 
 
 		 245 aa  299  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3788  short chain dehydrogenase  70.56 
 
 		 248 aa  297  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798977 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4719  short chain dehydrogenase  66.27 
 
 		 252 aa  288  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.358577 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4196  short chain dehydrogenase  66.27 
 
 		 252 aa  287  9e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0889  short chain dehydrogenase  66.67 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122847  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3552  short chain dehydrogenase  67.63 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4815  short chain dehydrogenase  67.63 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5468  short chain dehydrogenase  67.63 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.107727 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.16 
 
 		 243 aa  275  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.7 
 
 		 242 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.85 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0115742  normal  0.0276223 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5343  carbonyl reductase  51.04 
 
 		 242 aa  232  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.54 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.12 
 
 		 241 aa  218  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.48 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2155  short chain dehydrogenase  46.31 
 
 		 245 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0553289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000170009  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2462  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 		 254 aa  168  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0950  short chain dehydrogenase  42.06 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.477872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3287  short chain dehydrogenase  42.06 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3420  short chain dehydrogenase  42.06 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0769277  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2043  short chain dehydrogenase  42.69 
 
 		 254 aa  164  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1811  short chain dehydrogenase  41.5 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1794  short chain dehydrogenase  41.5 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.503189  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2073  short chain dehydrogenase  41.5 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.844507  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0363  short chain dehydrogenase  41.5 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0809  short chain dehydrogenase  41.5 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1100  short chain dehydrogenase  41.5 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0458  short chain dehydrogenase  41.11 
 
 		 256 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 		 250 aa  160  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.45 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4068  short chain dehydrogenase  40.64 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  39.04 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 		 267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.487626 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  43.43 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2818  short chain dehydrogenase  42.29 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2791  short chain dehydrogenase  42.29 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2835  short chain dehydrogenase  42.29 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1629  short chain dehydrogenase  39.37 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2568  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1573  short chain dehydrogenase  39.37 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0631529  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0308  putative short-chain dehydrogenase/reductase  42.04 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.33 
 
 		 246 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 256 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.281486  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.677514  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6072  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 		 251 aa  135  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  35.91 
 
 		 269 aa  135  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 254 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 258 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3848  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1819  glucose 1-dehydrogenase  38.46 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00010189  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0850  putative short-chain dehydrogenase/reductase  38.4 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.40253  normal  0.017932 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.82409  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7421  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101369  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  36.25 
 
 		 254 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 		 256 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  36.25 
 
 		 254 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 		 262 aa  128  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 253 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 		 268 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5719  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3418  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  36.86 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.233538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.170949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>