More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4815 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3552  short chain dehydrogenase  100 
 
 
241 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4815  short chain dehydrogenase  100 
 
 
241 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5468  short chain dehydrogenase  100 
 
 
241 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.107727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4719  short chain dehydrogenase  90.46 
 
 
252 aa  407  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.358577 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4196  short chain dehydrogenase  89.63 
 
 
252 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0889  short chain dehydrogenase  92.12 
 
 
252 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122847  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3788  short chain dehydrogenase  85.12 
 
 
248 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0505  short chain dehydrogenase  72.31 
 
 
246 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2430  short chain dehydrogenase  69.26 
 
 
248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0339  short chain dehydrogenase  69.33 
 
 
245 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3231  short chain dehydrogenase  67.63 
 
 
245 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304941  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1193  short chain dehydrogenase  69.26 
 
 
248 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2074  short chain dehydrogenase  69.26 
 
 
248 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1926  short chain dehydrogenase  69.26 
 
 
248 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00605891  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1913  short chain dehydrogenase  69.26 
 
 
248 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0862  short chain dehydrogenase  69.26 
 
 
248 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.140204  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0299  short chain dehydrogenase  69.26 
 
 
248 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.71932  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1636  short chain dehydrogenase  69.26 
 
 
248 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.140639  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.25 
 
 
243 aa  252  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
241 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550134  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.26 
 
 
241 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5343  carbonyl reductase  51.45 
 
 
242 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.74 
 
 
242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0115742  normal  0.0276223 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.72 
 
 
247 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.41 
 
 
242 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  44.53 
 
 
252 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2155  short chain dehydrogenase  46.67 
 
 
245 aa  175  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0553289  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
255 aa  172  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2073  short chain dehydrogenase  44.58 
 
 
256 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.844507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1811  short chain dehydrogenase  44.58 
 
 
256 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1794  short chain dehydrogenase  44.58 
 
 
256 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.503189  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
250 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0363  short chain dehydrogenase  44.58 
 
 
256 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1100  short chain dehydrogenase  44.58 
 
 
256 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0809  short chain dehydrogenase  44.58 
 
 
256 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  43.5 
 
 
249 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0458  short chain dehydrogenase  44.18 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2462  short chain dehydrogenase  41.98 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2568  short chain dehydrogenase  42.45 
 
 
251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459864  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.55 
 
 
235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3287  short chain dehydrogenase  42.57 
 
 
256 aa  161  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0950  short chain dehydrogenase  42.57 
 
 
256 aa  161  9e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.477872  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3420  short chain dehydrogenase  42.57 
 
 
256 aa  161  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0769277  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2043  short chain dehydrogenase  43.2 
 
 
254 aa  158  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 
254 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.487626 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
255 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000170009  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 
251 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2818  short chain dehydrogenase  40 
 
 
256 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2791  short chain dehydrogenase  40 
 
 
256 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2835  short chain dehydrogenase  40 
 
 
256 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
267 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
267 aa  149  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6072  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
256 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
254 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
274 aa  145  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
256 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.281486  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  35.16 
 
 
269 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.79 
 
 
254 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
276 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
267 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11729  oxidoreductase  41.43 
 
 
270 aa  142  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123352  normal  0.515207 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
255 aa  142  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
247 aa  142  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790972  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
256 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.51 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 
251 aa  140  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.677514  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
267 aa  140  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  37.75 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
268 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0308  putative short-chain dehydrogenase/reductase  41.39 
 
 
255 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
254 aa  139  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0850  putative short-chain dehydrogenase/reductase  39.67 
 
 
266 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.40253  normal  0.017932 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
257 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
255 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
263 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  37.01 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.37 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0908  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.29 
 
 
257 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
270 aa  135  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
263 aa  135  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03440  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  38.91 
 
 
257 aa  135  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
253 aa  135  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
257 aa  134  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.96 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00384997  hitchhiker  0.000208801 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000174886  normal  0.399546 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 
252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.686314  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1629  short chain dehydrogenase  37.25 
 
 
257 aa  133  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  36.36 
 
 
254 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09160  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
256 aa  133  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>