More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1629 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1629  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 257 aa  509  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1573  short chain dehydrogenase  99.61 
 
 		 257 aa  508  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0631529  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4068  short chain dehydrogenase  94.94 
 
 		 257 aa  464  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  71.6 
 
 		 256 aa  361  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2791  short chain dehydrogenase  63.28 
 
 		 256 aa  296  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2818  short chain dehydrogenase  63.28 
 
 		 256 aa  296  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2835  short chain dehydrogenase  63.28 
 
 		 256 aa  296  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0950  short chain dehydrogenase  54.3 
 
 		 256 aa  273  3e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.477872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3420  short chain dehydrogenase  54.3 
 
 		 256 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0769277  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3287  short chain dehydrogenase  54.3 
 
 		 256 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.03 
 
 		 255 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000170009  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.18 
 
 		 267 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.19 
 
 		 267 aa  248  6e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2568  short chain dehydrogenase  51.43 
 
 		 251 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2462  short chain dehydrogenase  48.22 
 
 		 254 aa  236  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  49 
 
 		 252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  48.78 
 
 		 249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0458  short chain dehydrogenase  48.8 
 
 		 256 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1811  short chain dehydrogenase  48.8 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1794  short chain dehydrogenase  48.8 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.503189  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2073  short chain dehydrogenase  48.8 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.844507  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0363  short chain dehydrogenase  48.8 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0809  short chain dehydrogenase  48.8 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1100  short chain dehydrogenase  48.8 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2043  short chain dehydrogenase  48.19 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.93 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.75 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.281486  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 255 aa  172  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1819  glucose 1-dehydrogenase  39.09 
 
 		 261 aa  168  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00010189  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  38.34 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  38.34 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0339  short chain dehydrogenase  37.9 
 
 		 245 aa  165  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3781  sorbitol dehydrogenase  38.58 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.360615  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 		 286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000174886  normal  0.399546 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0363  sorbitol dehydrogenase  37.01 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6072  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 256 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686827  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3231  short chain dehydrogenase  39.37 
 
 		 245 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 		 265 aa  162  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0298  sorbitol dehydrogenase  40.48 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0505  short chain dehydrogenase  37.35 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3850  sorbitol dehydrogenase  36.8 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4841  sorbitol dehydrogenase  38 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.34144  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  37.45 
 
 		 265 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 		 267 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2037  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 		 262 aa  158  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00988022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 255 aa  158  9e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1731  sorbitol dehydrogenase  37.11 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000368197  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0095  sorbitol dehydrogenase  37.11 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4813  sorbitol dehydrogenase  37.6 
 
 		 257 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  39.38 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.43 
 
 		 246 aa  156  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 		 253 aa  155  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0638  sorbitol dehydrogenase  38.82 
 
 		 261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.122771  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0692  sorbitol dehydrogenase  37.01 
 
 		 258 aa  154  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.84 
 
 		 246 aa  155  9e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0427  sorbitol dehydrogenase  36.61 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.619878 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3515  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.55 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  39.77 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20330  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  39.77 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  39.77 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2281  short chain dehydrogenase  38.67 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0489  sorbitol dehydrogenase  35.43 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000937678  hitchhiker  0.00159634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0269  sorbitol dehydrogenase  42.4 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 268 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  37.96 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0719  sorbitol dehydrogenase  36.22 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000035805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1926  short chain dehydrogenase  37.35 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00605891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  38.37 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41710  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.3 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2411  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.11 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3571  sorbitol dehydrogenase  36.25 
 
 		 258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.62 
 
 		 247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>